1998年4月，自治区人民政府直属机构有10个，分别是：自治区统计局、自治区工商行政管理局、自治区环境保护局、自治区土地管理局、自治区新闻出版局、自治区法制局、自治区乡镇企业管理局、自治区医药管理局、自治区粮食局、自治区水产局。
2000年机构改革，自治区人民政府直属机构调整为17个，分别是：自治区地方税务局、自治区环境保护局、自治区广播电影电视局、自治区体育局、自治区统计局、自治区工商行政管理局、自治区新闻出版局（自治区版权局）、自治区林业局、自治区质量技术监督局、自治区食品药品监督管理局、自治区旅游局、自治区粮食局、自治区水产畜牧兽医局、自治区信息产业局、自治区外事办公室、自治区侨务办公室、自治区法制办公室。
2004年机构改革，自治区人民政府增加自治区安全生产监督管理局为直属机构。至2007年底，自治区人民政府直属机构共有18个。同时，自治区人民政府设立直属特设机构自治区国有资产监督管理委员会。
自治区人民政府直属特设机构和18个直属机构的成立时间、行政级别及主要负责人任职情况如下：
自治区国有资产监督委员会（正厅级） 2004年1月设立。
主要负责人任职情况
自治区地方税务局（正厅级） 1994年8月12日成立。
主要负责人任职情况
自治区环境保护局（正厅级） 1974年7月设立自治区环境保护委员会，下设办公室（设在自治区计委）。1975年3月归自治区建委领导。1984年10月设立自治区环境保护局（副厅级）。1995年6月升格为正厅级。
主要负责人任职情况
自治区广播电影电视局（正厅级） 1956年11月设立广西省广播事业管理处。1958年更名为自治区广播管理处。1971年7月设立自治区革委会广播局。1980年1月更名为自治区广播局。1983年9月改设自治区广播电视厅。1998年更名为自治区广播电视总局。2000年3月更名为自治区广播电影电视局。
主要负责人任职情况
自治区体育局（正厅级） 1954年2月设立省体育运动委员会。1958年3月，更名为自治区体育运动委员会。1971年12月设立自治区革命委员会体育运动委员会，1973年8月更名为自治区体育运动委员会。1998年更名为自治区体育总局。2003年3月，更名为自治区体育局，为自治区人民政府直属机构。
主要负责人任职情况
自治区统计局（正厅级） 1953年6月设立省人民政府统计局。1955年2月更名为省统计局。1957年并入省计划委员会。1959年6月设立自治区统计局，1979年8月恢复设立自治区统计局，为自治区人民政府组成部门。2000年改为自治区人民政府直属机构。
主要负责人任职情况
自治区工商行政管理局（正厅级） 1954年5月设立广西省人民政府工商行政管理局，1955年11月撤销。1963年11月恢复设立自治区工商行政管理局。1974年12月恢复设立自治区革委会工商行政管理局。1980年1月更名为自治区工商行政管理局。1999年1月，自治区工商行政管理局实行自治区以下工商行政管理机关垂直管理体制。
主要负责人任职情况
① 刘君，因严重违纪，2018年2月被开除党籍和行政撤职。［来源：广西纪检监察网］
自治区新闻出版局（自治区版权局）（正厅级） 1978年8月设立自治区革委会出版事业管理局。1980年1月改为自治区出版事业管理局。1984年3月并入自治区文化厅。1988年6月设立自治区新闻出版局。1996年自治区新闻出版局挂广西壮族自治区版权局牌子。
主要负责人任职情况
自治区林业局（正厅级） 1950年2月设立省人民政府农林厅。1954年7月撤销省农林厅，设立省林业厅。1957年12月与农垦厅合并，改设林垦厅。1958年10月撤销林垦厅，设立林业厅。1971年1月设立自治区革委会农林局，1973年8月撤销农林局，改设自治区革委会林业局。1980年1月更名为自治区林业局。1984年2月更名为自治区林业厅，为自治区人民政府组成部门。2000年改为自治区人民政府直属机构。
主要负责人任职情况(www.xing528.com)
自治区质量技术监督局（正厅级） 1978年4月设立自治区标准计量管理局。1979年4月更名为自治区计量管理局，同年9月成立自治区标准局。1984年3月计量管理局与标准局合并，成立自治区标准计量局（副厅级），归自治区经济委员会领导。同年10月恢复自治区标准计量局。1989年，自治区标准质量局更名为自治区技术监督局，为自治区人民政府直属机构。2000年3月更名为自治区质量技术监督局。
主要负责人任职情况
自治区食品药品监督管理局（正厅级） 1979年11月设立自治区医药管理局。1983年8月改为自治区医药总公司（企业经济组织）。1986年5月改为自治区医药局，行使政府职能。2000年3月撤销医药局，组建自治区药品监督管理局。2004年1月更名为自治区食品药品监督管理局。
主要负责人任职情况
自治区安全生产监督管理局（正厅级）2001年7月组建自治区安全生产监督管理局，为自治区经济委员会的内设机构。2004年1月升格为自治区人民政府直属机构（正厅级）。
主要负责人任职情况
自治区旅游局（正厅级） 1978年6月设立自治区旅行浏览事业管理局。1983年12月更名为自治区旅游局。1995年3月改为自治区旅游事业局，为自治区人民政府直属事业单位。2000年3月更名为自治区旅游局，为自治区人民政府直属机构。
主要负责人任职情况
自治区粮食局（正厅级） 1952年12月设立省人民政府粮食厅。1955年2月更名为省粮食厅。1958年3月更名为自治区粮食厅。1972年7月恢复设立自治区革委会粮食局。1980年1月更名为自治区粮食局，并列为自治区人民政府直属机构。
主要负责人任职情况
自治区水产畜牧兽医局（正厅级） 1973年8月设立自治区革委会水产局。1981年3月更名为自治区水产局。1984年4月并入自治区农牧渔业厅。1985年4月恢复设立自治区水产局（副厅级），归自治区农牧渔业厅领导。1995年3月设置自治区水产局，同年5月由副厅级机构升格为正厅级机构。2000年3月自治区水产局与自治区畜牧局合并，组建自治区水产畜牧局。2007年4月更名为自治区水产畜牧兽医局，为自治区人民政府直属机构。
主要负责人任职情况
自治区信息产业局（正厅级） 1976年3月设立自治区电子工业办公室。1980年1月设立自治区电子工业局。1984年8月并入自治区经济委员会，同年更名为自治区电子工业公司（企业）。1986年6月更名为自治区电子工业局。2002年2月将电子工业局和自治区无线电管理委员会办公室合并，成立自治区信息产业局。
主要负责人任职情况
自治区外事办公室（正厅级） 1952年10月设立省人民政府外事处，1959年4月设立自治区人委会外事办公室。1962年8月外事办公室与自治区人委会外事处合署办公。1973年8月设立自治区革委会外事办公室，1980年1月更名为自治区人民政府外事办公室。1995年更名为自治区外事办公室。
主要负责人任职情况
自治区侨务办公室（正厅级） 1960年2月成立自治区华侨事务委员会。1973年9月设立自治区革委会侨务局。1978年4月更名为自治区革委会侨务办公室。1981年9月更名为自治区华侨企业管理局。1998年将自治区侨务办公室定为自治区人民政府办事机构。2000年6月自治区侨务办公室更改为自治区人民政府直属机构。2004年1月自治区华侨企业管理局撤销，其行政职能并入自治区侨务办公室。
主要负责人任职情况
自治区法制办公室（正厅级） 1986年9月设立自治区法制局，同年10月定为正厅级单位，属自治区人民政府办事机构。2000年3月撤销自治区法制局，组建自治区政策法规室，为自治区人民政府直属机构。2004年2月政策法规室更名为自治区法制办公室，更名后机构规格及职能不变。
主要负责人任职情况
① 林日华，因违规违纪，2015年10月被开除党籍和行政撤职。［来源：广西纪检监察网］
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