随着全球化的发展与经济一体化进程的加速，非传统安全问题日益突出。面对这一新形势，各国海关的职能也在延伸，关注国家稳定与安全的非传统职能快速发展，突出了对供应链安全的管理。“9 · 11”恐怖袭击成为这一转变的标志性事件，各国海关及相关国际组织的关注重点从贸易便利转变为安全和反恐措施。
1）改革机构体制强化边境保护功能
“9 · 11”事件发生后，美国为了整合边境执法资源，确保领土的绝对安全，于2003年成立了国土安全部，收编了包括原隶属于财政部的海关署，原海关署被分为海关与边境保护局、移民与海关执法局两个机构。欧盟税务及海关同盟总司将“管理并保护欧盟统一的外部边境”确立为主要职能之一。新西兰海关“2006—2010年海关成果目标”中的第一项内容就是“边境安全——提高海关的协同作战能力”。边境安全问题已然成为各国关注的首要问题。
2）出台一系列供应链安全和危机应对的新规则
如世界海关组织2005年出台的《全球贸易安全和便利化标准框架》，美国出台的海关—商界反恐伙伴计划（C-TPAT）、集装箱安全倡议（CSI）、24 h 提前申报规则、出台的“10+2”申报制度，中欧的安全智能贸易航线试点计划，拉丁美洲的安全商务伙伴计划等。2010年为应对不断出现的自然灾害、流行性疾病等突发性事件对全球供应链的影响，欧盟建立了海关危机应对网络，各成员海关间实现了最高管理层间的网络连通。(www.xing528.com)
3）强调保障整个供应链的安全
各国海关都强调通过海关与海关之间、海关与商务对象之间的合作，运用风险管理、资源共享等手段以保护商业运输免受恐怖袭击、大规模杀伤性武器和非法走私等威胁。而这种供应链安全的要求要覆盖到供应链的所有参与者（表1）和所有环节。
表1 供应链安全的主要成员及其承担的角色
（续表）
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