从1981年恢复生物学高考，到1994年停止生物学高考的14年间，高考生物命题随高考制度改革而出现了三次大的变化：
（l）1981年—1985年，全国高考开始实行大文、大理的招生考试制度。生物学虽然纳入了理科考生的必考科目，但分数比重从1981年以30%考分计入，总分，到1982年以50%的考分计入总分，生物学教学地位明显偏低，高考生物命题也只是五、六十年代意义上的传统化命题。
（2）1986年—1990年，生物学考分提高到70%，受国外标准化考试的影响，布卢姆关于知识结构的目标分类原则的引进，题型的相对稳定，高考生物命题逐步趋向标准化，演化为趋向标准化命题。
（3）1991年—1994年，高考制度开始变革，实行了在毕业会考制度上的高考，同时于91年开始了“三南”，高考试点，农林医类考生需选考生物，分数权重与其他科目等同，都是150分。布卢姆的目标分类原则作为考试目标直接反映在会考考纲和高考考试说明中，命题过程中对效度、区分度、难度和信度的准确把握、题型的细化和固定，以及评分标准的客观性、唯一性，使高考生物命题进入到了标准化命题模式。从89年开始在全国各省市逐步推行的高中毕业会考，其生物学命题也可视为标准化命题。(www.xing528.com)
在中断了四年生物高考之后，1999年在广东省首次推出了“3+XP”，高考科目改革，生物作为X科中的一门，再次被列为高考选考科目。其高考生物命题模式也发生了质的变化，注入了新的活力，体现了新的能力要求和素质要求，可以说进入到了一个新的境界——素质化命题。
素质化命题是指转变以知识立意为主的命题指导思想为以能力立意为主的命题指导思想，更加注重考查考生的基础文化素质和创新意识、创新能力，考查考生进入高校以后的学习潜能。转变传统的封闭的学科观念，增加学科间知识的相互渗透，突出综合能力和综合素质的考查。它综合了传统化命题、趋向标准化命题和标准化命题的优点，避免了91年以来的生物标准化命题中强调评分标准和试题答案的确定性和唯一性，而对测量诸如发散思维、创造力，没有唯一答案的现实问题的分析能力、写作能力等方面的水平显得无能为力的缺点。
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