了解南部海区的情况对德军潜艇部队指挥机关来说还是很有价值的。因为将来很可能在某一时候会把潜艇战的战场转移到南部海区。
因此，邓尼茨在1940年6月派了一艘U－A号潜艇到南部海区去。该潜艇原来是为土耳其海军建造的，战争之初被德军接收。这艘潜艇的尺寸和操纵性能难以适应在北部海区对护航运输队的作战。1940年11－12月，U－65号潜艇也被派遣到南大西洋。该潜艇在战斗中取得了理想的战果。但与北部海区相比，它在长时间的作战中所取得的战果还不算大。依据海战指挥部的一项合同指令，邓尼茨在1941年初又派U－37号潜艇到南大西洋。
直到1941年2月，当潜艇在北部海区的需要量有所下降时，邓尼茨才决定将一些大型的IX型潜艇派往南大西洋的弗里敦作战海区。在头4个月，这些潜艇取得了相当满意的战果，以至几乎弥补了当时从北部海区将它们撤走所造成的损失。然而，即使它们在该战区所获得的最大战果也不及德军1940年夏在北部海区所取得的最大战果。
不过，潜艇却常常被别的部门调遣。根据空军总司令部的要求，有2艘作战潜艇被派遣到预定海区执行气象报告任务，每天要报告2－3次，因此它们就不能参加潜艇战。
随着苏德战争的爆发，有8艘潜艇被派到波罗的海参加对苏作战，但它们几乎连一个目标也没有捕捉到，因而毫无战果，于是在1941年9月这些潜艇又归邓尼茨指挥。
从1941年7月起，又有4－6艘潜艇被派往北冰洋同苏联作战，那段时期同盟国在海上没有进行补给运输，这些潜艇在海上同样找不到目标。(www.xing528.com)
德国的辅助巡洋舰、突破封锁舰、补给舰和战利品船在漫长的往返途中经常要有一艘潜艇陪同。1941年11月初海战指挥部又令潜艇部队指挥机关再派14艘潜艇去执行一些次要的任务，这样邓尼茨们在大西洋作战的潜艇只剩下5－10艘了。对此邓尼茨表示强烈不满，他写道：“潜艇部队司令一直坚决认为，潜艇战的主要任务是攻击敌舰船，只有通过攻击才能使潜艇在英国面前显示威力。如果潜艇战停止几个星期，那只能使英国感到高兴。出于政治战略的需要，部分潜艇已分散部署，这是势在必行，迫不得已的事。但邓尼茨认为，为了一些次要的任务而不断分散潜艇，使大西洋潜艇战面临瘫痪状态的现象应该坚决避免……
“由于抽调潜艇而造成潜艇战兵力的削弱是不能按抽调潜艇后所造成的击沉敌舰船的百分比的下降来具体计算的；失去一艘潜艇所产生的影响远比此大。在侦察中减少一艘潜艇就意味着减少侦察情报和减少搜索目标的机会。而搜索目标却是潜艇战中最棘手的问题。
“除搜索目标外，缺少一艘潜艇也意味着减少于与敌保持接触和中断接触后重新恢复接触的希望。
“在攻击中，实施攻击的潜艇数量愈多，每艘潜艇获得成功的希望就愈大，突破敌防御的把握也愈大。总而言之，这就是说：被抽调去执行次要任务的潜艇不仅失去了其本身取胜的希望，同时也将大大降低其它剩余潜艇在潜艇战中取得成功的希望。”
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