《經略復國要編》原書共十四卷，卷首收明神宗敕諭一道及圖序、圖繪、圖説資料，正文前後有《附》和《後附》各一卷，總共收文書五百七十六份。本次點校整理首列江蘇省立國學圖書館影印本原收近人繆鳳林所撰《經略復國要編提要》，其餘卷次、篇目一仍原著，但圖序、圖繪、圖説資料遵照外審意見從删。附録除收原影印本所收明人黄汝亨所撰《明兵部左侍郎經略桐岡宋公配顧淑人墓誌銘》《經略朝鮮薊遼保定山東等處兵部左侍郎都察院右都御史宋公行状》外，又新收明人王錫爵所撰《經略朝鮮薊遼保定山東等處軍務兵部左侍郎都察院右都御史桐岡宋公神道碑》和清人萬斯同所撰《明史·宋應昌傳》，並收本書未載宋應昌戰事相關文書目録。
本次點校整理以北京大學圖書館所藏的明萬曆刻本爲底本録文，點校整理成果以規範的繁體字排版，段落劃分以所述事項爲標准，標點時採用新式標點符號，務求准確嚴謹。文中出現雖屬並列關係，但習慣上連稱而不致引起誤會的詞語，不作點斷，如官署、官職名『户兵二部』『吏兵二部』『督撫』『參遊』等，地名『浙直』『全慶』等，人名『頗牧』『艾張主事』等，事項名『中西二協』『明毒火箭』『米豆』『馬騾』『衣犒銀』『行月糧』『咨揭』等。但多重官名、地名連用時可能引起誤會時則以頓號點斷，如『督、撫、鎮、道』『天、密、薊、永、遼、海、登、萊』等。
文書標題以撰者原擬爲准，部分没有標題的文書直接以前銜（作者名以及職銜名）和事由組合的形式新擬標題，如《兵部一本爲倭情叵測懇乞聖明遣大臣經略征討以伐狂謀以弭隱患事》。正文中涉及的没有明確標題的文書，亦根據叙述情况將文中部分内容作爲標題，但因這類文書在文中多有轉述情况，前銜往往發生變化，故一般只以事由爲標題，如『該本部題《爲仰奉明旨再陳未盡事宜以定東封事》』。
字體以底本爲准，遇見新舊字體、正俗字體不統一者，一般採用現在通用的正字字體，如『飡』↓『餐』、『荅』↓『答』，『荳』↓『豆』，『躱』↓『躲』，『畧』↓『略』，『蔴』↓『麻『、『牆』↓『墻』，『強』↓『强』，『筭』↓『算』，『徃』↓『往』，『迯』↓『逃』，『廵』↓『巡』，『災』↓『灾』，『輙』↓『輒』等。部分通用俗字在底本中大量使用，則予以保留。對於手寫體中常見的『扌』旁與『木』旁、『巾』旁與『忄』旁、『衤』旁與『礻』旁等混用，一般徑據文意録定。(www.xing528.com)
部分漢字形異意亦不同者，如『台』『臺』，『乾』『幹』『干』等，今一仍底本而不做調整。部分漢字形異而意之同異兼有者，如『並』『并』『併』，『裸』『裏』『里』等，今亦一仍底本而不做調整。
人名、地名等固有名詞如『李承勛』『寗國胤』『王必廸』『顧台星』『于世科』『台州』『芝蔴灣』等，亦一仍底本而不做調整。
校勘時選用國内外所藏較爲重要的各種公私史籍作爲參考，以文字對校爲主，以校勘記説明校勘情況。底本文字不誤而校本與底本文字有異者，列出異文。校本文字明顯有誤者，不出校。正文改字不在正文中標注增删符號，但在校勘記中説明校改依據。底本有阙字或無法識别以及僅存殘跡之字，用『□』號表示，阙一字或殘一字用一個『□』號，阙多字或殘多字用多個『□』號。如所阙、所殘之字據前後文或他本或文意可以補出者，則徑自補上，並出校説明依據。底本如有脱文能補入者，則於所補文字之上加『[ ]』以示區别，並於文後出校説明補入依據。不能補録者直接點斷。底本有訛文、衍文、倒文者，於正文内徑加改正、删除、乙正，同時出校説明依據。校勘記附於每卷卷後。
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