长期应付款是指事业单位发生的偿还期限超过1年（不含1年）的应付款项，主要指事业单位融资租入固定资产发生的应付租赁款、跨年度分期付款购入固定资产的价款等。
为了核算单位发生的偿还期限超过1年（不含1年）的应付款项，如以融资租赁方式取得固定资产应付的租赁费等，应设置“长期应付款”科目。本科目应当按照长期应付款的类别以及债权人进行明细核算。本科目期末贷方余额，反映单位尚未支付的长期应付款金额。
长期应付款的主要账务处理如下。
（1）发生长期应付款时，借记“固定资产”“在建工程”等科目，贷记本科目。
（2）支付长期应付款时，按照实际支付的金额，借记本科目，贷记“财政拨款收入”“零余额账户用款额度”“银行存款”等科目。涉及增值税业务的，相关账务处理参见“应交增值税”科目。
（3）无法偿付或债权人豁免偿还的长期应付款，应当按照规定报经批准后进行账务处理。经批准核销时，借记本科目，贷记“其他收入”科目。核销的长期应付款应在备查簿中保留登记。
（4）涉及质保金形成长期应付款的，相关账务处理参见“固定资产”科目。
【例29】 某事业单位向B租赁公司融资租入计算机100台，据融资协议规定，租赁期5年，从第3年开始每年末采用财政授权支付的方式支付融资租赁款25万元。
（1）收到计算机时
借：固定资产——计算机 750000
贷：长期应付款——B公司 750000
因该经济业务未涉及纳入部门预算管理的实质性现金收支，故预算会计不需要进行账务处理。
（2）第3年末，根据合同的约定支付融资租赁款250000元。
借：长期应付款——B公司 250000
贷：零余额账户用款额度 250000
因该经济业务涉及纳入部门预算管理的现金支出，故预算会计需进行如下的账务处理：
借：事业支出 250000
贷：资金结存——零余额账户用款额度 250000
【例30】 某科研单位向甲公司购入一幢办公楼，价值7000000元。根据购买合同的约定，事业单位将扣留10%的价款作为质量保证金，扣留时间为两年。
（1）在办公楼交付使用时，事业单位采用财政直接支付方式向房地产开发商支付购房款6300000元，其余700000元作为扣留的质量保证金。房地产开发商为事业单位开具了全款发票。
借：固定资产——办公楼 7000000
贷：财政拨款收入 6300000
长期应付款——甲公司 700000
因该经济业务涉及纳入部门预算管理的现金支出，故预算会计需进行如下的账务处理：(www.xing528.com)
借：事业支出 6300000
贷：财政拨款预算收入 6300000
（2）办公楼质量保证期满后，事业单位采用财政直接支付方式向房地产开发商支付700000元扣留的质量保证金。
借：长期应付款——甲公司 700000
贷：财政拨款收入 700000
因该经济业务涉及纳入部门预算管理的现金支出，故预算会计需进行如下的账务处理：
借：事业支出 700000
贷：财政拨款预算收入 700000
【例31】 某事业单位根据专业业务发展的需要，用非财政补助资金以分期付款方式向A企业购入不需安装甲设备一台，根据购买合同，甲设备价款为60000元，款项分3年在每年末支付。
（1）事业单位在收到该设备并通过银行存款支付运费300元。
借：固定资产——甲设备 60300
贷：长期应付款——A企业 60000
银行存款 300
因该经济业务涉及纳入部门预算管理的现金支出，故预算会计需进行如下的账务处理：
借：事业支出 300
贷：资金结存——货币资金 300
（2）第一年末，根据合同的约定用银行存款支付货款20000元。
借：长期应付款——A企业 20000
贷：银行存款 20000
因该经济业务涉及纳入部门预算管理的现金支出，故预算会计需进行如下的账务处理：
借：事业支出 20000
贷：资金结存——货币资金 20000
第二年末、第三年末的账务处理同上。
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