美国是远东国际军事法庭的实际主导方。法庭结束审判之后，相关的一系列资料都被移交给美国国家档案馆保存。毫无疑问，该馆是收藏东京审判相关档案最为系统、完备和丰富的机构。美国国家档案馆所藏东京审判相关资料主要归在编号RG43、RG125、RG153、RG238和RG331几组文献中，内容涵盖远东委员会、盟军最高司令部及其下属国际检察局、远东国际军事法庭等相关机构的庞大文献。在此对几组重要的文献组稍做展开介绍：[7]
1.远东委员会相关
远东顾问委员会（FEAC）由澳、加、中、法、印、荷、新、菲、英、美各国代表组成，作用是为占领日本期间的各种政策提供咨询。1946年莫斯科会议后苏联加入，远东委员会（FEC）代替了远东顾问委员会。远东委员会的重要职能之一就是考虑对日本战争犯罪嫌疑人确认、逮捕、审判的一系列问题，并授权盟军最高司令部建立军事法庭。同时该委员会对战争犯罪（反和平罪和反人道罪）的概念及范畴也进行了广泛和详细的说明。
在RG43组文献“Records of International Conferences，Commissions，and Expositions”下保存有大量（约150包）远东委员会及其前身远东顾问委员会的相关资料。包括1946—1951年的会议记录、备忘录、政策文件、侦办战争犯罪的探员名单、由盟军最高司令部法律部和国际检察局搜集的各种档案，以及大量的附录清单。
2.远东国际军事法庭（lMTFE）相关
与远东国际军事法庭审判即东京审判的档案主要保存在RG153和RG238组档案中，前者题为“Records of the Judge Advocate General（Army）→War Crimes Branch”，后者题为“National Archives Collection of World War II War Crimes Records→Records of the International Military Tribunal for the Far East（IMTFE）1946-1948”。主要内容有：
●起诉书、全部公开庭审的逐字记录、判决书和最终判决。
●五名法官的少数意见书。
●庭长办公室审理记录。
●法庭证据文献。
●法庭驳回证据，包含检、辩双方被驳回的证据文件。
●辩方文书，即所有辩方文书中没有被作为证据提出的部分。
●1948年宣判后给麦克阿瑟的要求重新考虑判决和量刑的请愿书。
●关于麦克阿瑟将军对法庭判决的评估记录。(www.xing528.com)
●1946年3月18日—1948年11月9日法庭的官方照片，共750张。包括法官、检察团和辩护团成员、被告、证人、其他法庭工作人员、来访者、法庭场景和部分证据的照片。
●法庭公文，包含被告方的动议和请愿书文件、法官、律师及证人的宣誓文件、被告健康状况证明、文件的提出、撤回及修正等申请。
●其他各式记录，包含庭审记录部分概要、修订记录、法庭宪章副本、法庭成员宣誓不对外泄露庭审情况的文件、辩护律师个人简历等。
●法庭日报，内容包括每天的公开庭审摘要和庭长办公室记录摘要，以及庭长与最高司令部、国际检察局代表之间的会议。
●各类索引和列表。包括检、辩双方案件的人名及主题索引、证人人名索引、诉讼案件索引、证据列表等。
3.驻日盟军司令部相关
盟军最高司令部经美、英、苏、中四国政府协商，按当时美国总统杜鲁门的指示于1945年8月14日指派麦克阿瑟将军为驻日盟军最高司令官，对日本实施间接统治，迫使其遵守投降文书中的款项，于1952年旧金山和约签署之后解散。
该机构相关资料集中保存于RG331组文献“Records of the Allied Operational and Occupation Headquarters，World War II”中，对于了解美国对占领日本时期的政策倾向、各国对于惩办战争犯罪的态度、协商和后来的实施情况非常重要。其中主要包含三个部门的资料：
法务部记录：法务部主要负责制定一般性法律事务的政策和工作准则，因此其内容范围包含了A、B、C级审判，除了荒木贞夫、东条英机等A级被告的卷宗、东京审判庭长办公室审理记录、东京审判判决书之外，还有田村浩、丰田副武两个B级审判的记录以及不少个人口供书和声明。
行政部记录：该条目下相关记录包括1945—1948年的战争罪犯的调查（2包）和讯问报告（1包）。不过通过与粟屋的《国际检察局讯问记录》中的名单对比，此处的讯问名单与同组“IPS记录”条目下的相关内容有很大的出入，且体量也小很多。在进一步探明之前，尚不能确定两者之间的关系。
国际检察局记录：内容包括1946至1948年间首席检察官季南的往来信函、检察局工作人员记录、经过编号的案宗、证人和嫌疑人文件、作为证据而搜集的各式文件、证据分析报告、辩方文书、重要嫌疑人的日记、法庭各式公文、英日两种语言的庭审记录、法庭证据文件、判决书、媒体相关报道的副本以及其他各式文件，等等。此外，在另外两组文献中也保存一部分国际检察局的部分文，分别是RG 125“海军军法处记录——战争犯罪”和RG 153“陆军军法处记录——战争犯罪”。
可以看出，以远东国际军事法庭为专题的RG238组文献在数量和文献完备性上显然都胜于其他编组，它与以盟军最高司令部（国际检察局）为专题的RG331组文献一起组成了东京审判的重要史料群。
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