以水权制度为核心，建立水资源取、供、用、排、回用全过程的用水管理制度体系。
4.2.1 建立健全用水总量控制和定额管理制度
根据各流域和各区域的水资源开发利用现状，根据水资源承载能力，按照各行业的性质和要求，合理确定各种用水标准，确定水资源的宏观控制指标和微观定额指标，明确各地区、各行业、各部门乃至各单位的用水指标，确定产品生产或服务的科学用水定额，规定社会每一项工作或产品的具体用水量要求，通过控制用水指标实现节水。制定用水总量控制与定额指标，还要采取行政与经济手段，保证指标的落实。
4.2.2 建立水权分配、转让和管理制度
建立水权制度，明晰初始用水权，确定各区域的用水权指标。我国在水资源国有的前提下，水权制度主要是建立使用权的分配制度与交易制度，个人和团体在履行法定程序后，依法享有在特定地点和时间内的使用权。在各流域或区域分配初始用水权时，要统筹生态用水和环境用水；统筹好上下游、左右岸，特别是行政区划之间的关系，协调好经济发达地区和相对落后地区、城市和农村、工业和农业之间的关系；水权分配要有利于促进经济结构和产业结构调整，优化水资源配置，提高水资源承载能力。
4.2.3 建立健全科学的水价制度
按照补偿成本、合理收益、优质优价、公平负担的原则，制定水利工程供水价格和城市用水价格。建立合理的调价机制，使水价反映用水的价值和供求关系。
实行用水定额管理、超定额累进加价制度。要合理确定用水定额、基价和水价级差，在定额以内，水价要考虑居民的承受能力。生活用水、工农业生产用水，根据用水定额和用水计划，实行定额基价、超定额累进加价，以促进节约用水。在水源丰枯变化较大、用水矛盾突出的地方，实行丰枯水价，引导用水户避开用水高峰期，激励合理用水，缓解供需矛盾。合理确定和调整回用水价格，促进中水回用和再生水利用。
4.2.4 健全“三同时四到位”制度和水资源有偿使用制度
新建、扩建、改建项目，必须制定节水方案，配套建设节水设施。节水设施应当与主体工程同时设计、同时施工、同时投产（即“三同时”）。在取水许可审批和年检时要求取用水户做到用水计划到位、节水目标到位、措施到位、管理制度到位（即“四到位”），保证各个用水户按计划用水和节约用水。
要按照《中华人民共和国水法》规定，尽快制定出台全国性的水资源费征收管理条例，健全水资源有偿使用制度。(www.xing528.com)
4.2.5 健全水资源论证制度
国民经济和社会发展规划以及城市总体规划的编制、重大建设项目的布局，应当与当地水资源条件相适应，并进行科学论证，使区域发展战略和经济布局与水资源条件相适应。将水资源论证制度、取水许可制度与水权制度有机结合，统筹考虑区域经济社会发展和流域水资源开发利用节约保护的需要，统筹考虑单个项目取水个别成本和效益与社会成本和效益，使区域发展与水资源条件相适应。
4.2.6 健全水功能区管理制度与排污许可制度
完善水功能区管理制度。按照流域综合规划、水资源保护规划和经济社会发展要求，对江河、湖泊等各类水域进行水功能区划，制定各类水功能区的保障措施，加强饮用水水源保护区管理，保证城乡居民饮用水安全。
建立健全排污总量控制和排污许可制度。水行政主管部门按照水功能区对水质的要求和水体的自然净化能力，核定水域的纳污能力，向环保部门提出排污总量意见，作为制定污染物排放总量控制实施方案的依据。建立入河排污口登记制度和审批制度，并实施监督管理。完善排污许可制度，逐步建立排污权管理制度，在有条件的地区开展排污权交易试点，尝试利用市场机制实现水环境资源的优化配置。
4.2.7 建立节水产品认证和市场准入制度
健全和完善节水设备（产品）和生活节水器具的标准，对节水产品实行产品认证制度，扩大节水产品的市场份额，提高节水产品的质量和生产企业的管理水平，推动节水技术的进步。
实施节水产品市场准入制度。从生产、流通和消费等环节，加强监管，对不符合节水要求的产品，不得生产、销售和使用。积极采取措施，推广节水生活器具。
4.2.8 完善水资源统一管理制度
以流域为单元实行水资源统一管理、统一规划、统一调度，统筹协调上下游、左右岸、干支流之间的关系，分配行政区域用水权；统一管理区域范围内地表水与地下水、水量与水质、城市与农村水资源，分配城乡和各行业用水权；统筹考虑水的多种功能，统筹蓄水、供水、用水、排水、污水处理及中水回用等各环节，科学合理配置水资源，建立全过程节水管理制度。
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