光秀很快就知道了秀吉的行军，顿时懊恼起来。
失算之余，他也命令全军出动，务必要抢在秀吉之前，拿下山崎。
双方争夺的焦点，是位于山崎的天王山。
天王山海拔二百七十米，是山崎原的第一制高点。只要占领山头，便能清楚地看到敌我双方的一举一动，而且铁炮弓箭之类的武器也更加有利于发挥作用。
决战的日期是六月十三日，天下着雨。
正午，秀吉最后召开一次战前会议。而此时，光秀军也由鸟羽出发，强渡桂川，到达了胜龙寺城。因为光秀几乎没有拉拢来一个同盟，连原本带兵出战的筒井顺庆，此时也突然撤退回了领地，所以他总共的兵力只有一万六千人，处于相当的人数劣势中。
尽管人数上不如人，但因为离着山崎近，大约在下午五点的时候，明智军便抢先占领了天王山，并且在拼抢的过程中，将高山重友和中川清秀的队伍给冲散了。
攻占了天王山之后，明智军开始居高临下，对四处乱走的中川清秀军发起了进攻，攻势极猛，一时间中川军呈现出了败退的状势。而另一边，刚刚赶到战场的明智方大将斋藤利三，也对高山重友发起了进攻，并且成功将其击退，羽柴军陷入了苦战之中。
在这一片苦战中，最苦的，还当属跟高山站在一块儿的中川队：高山一退，从山上冲下来的，从山下杀上来的明智军都成了他的对手。眼看着中川清秀也要和高山重友一个样，被直接打扫出战场了，幸好池田恒兴和加藤光泰两队人马及时赶到，加入了战斗之中，双方再次展开了一进一退的拉锯战。
此时，羽柴秀吉果断下令： “关门，放秀政。”
秀政指的是美浓出身的名将堀秀政，从十二岁起就开始跟随秀吉，外号“名人久太郎”。
他的出场，让明智军顿时陷入了一片混乱之中。
个中原因，自然是堀秀政过于彪悍，能够做到以一当十，一脚踢不飞对手三十米——才怪。
事情的起因要从数天前秀吉从和毛利家的战场上撤退时说起。
当时，惠琼为了向秀吉转达清水宗治同意切腹的消息，再次来到了羽柴军营，接待他的是黑田孝高。双方寒暄了几句之后，官兵卫突然表示，为了庆祝双方成功议和，不如互相送点什么礼物吧？(www.xing528.com)
惠琼同意倒是同意了，不过一时之间不知道送些啥玩意儿好。
早有准备的官兵卫说道： “战场之上，唯有军旗才能显出武士之礼仪，不如，就送些军旗吧。”
说着，他一挥手，手下人捧出了数百面羽柴家的军旗。
没等对方作出反应，他接着又说道： “大师（惠琼是和尚）不如也送我方几百面毛利家的军旗吧？”
面对如此死皮赖脸地讨要礼物，惠琼一时不知如何回答，无奈之余便只好应承了下来，然后带着一堆没用的刻着羽柴家纹五七桐的破旗子回到了自己的本营。
自然，羽柴家也如愿收到了几百面刻着毛利家纹的旗帜。
现在，这些旗帜都无一例外地插在了堀秀政队的背上。
明智军惊呆了。
难道，毛利家也加入了羽柴方？
趁着这个机会，中川清秀一下子活跃了起来：他先是迂回前行，突然出现在了天王山的山顶，然后又进入了加攻加防的暴走状态，从山顶上一鼓作气向着斋藤利三的侧翼就直冲了过去，并且还配以铁炮大肆射击。很快，利三队就处在了混乱接近崩溃的状态了，此时明智家家臣松田政近前往利三处救援，却被正处在勇猛无敌状态中的中川清秀三下两下地追打下了山，在山脚，他又碰上了堀秀政，两面一个夹攻，松田就这么战死了。
而秀吉一看形势大好，便不断地向右翼增添兵力，将斋藤利三团团包围。由于光秀本阵比较靠后，所以他的左翼非常薄弱，正巧摊上了秀吉的猛攻，所以一下子便全线崩溃了。
前阵的崩溃很快就连累到了全军，一时间明智方兵败如山倒，连光秀本人也不得不退入了胜龙寺城，之后，又从胜龙寺城逃出，前往阪本城（滋贺县内）。
但是，他最终没能到达阪本。
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