国防项目组合管理从内涵上属于组织级项目管理范畴。因此，需要建立一套有效机制，以解决企业组织长期性与项目组织的临时性、员工长期发展与项目生命周期属性之间的矛盾。同时，就管理机制构成及其相互联系、相互作用、工作方式、制度、方法、形式和规律等做出合理安排，是确保国防项目组合管理成功的重要方面，主要包括项目选择机制、资源配置机制、绩效考评与激励机制等。
1.项目的选择与决策
项目是企业生存与发展的关键，是企业战略目标实现的载体。企业内众多的项目构成项目组合，如何在有限的资源范围内，使得所选的项目能够更好地实现企业的战略目标，就需要项目选择与决策机制。
国防项目组合管理首先要确定项目及项目群的构建，选择与决策合适的国防项目组合，必须是要建立规范化的项目选择程序和科学的评价标准。下列问题的提出与满意回答有助于项目的选择与评估。
（1）该国防项目及项目群是否与组织的战略目标一致？
（2）组织是否具有足够的人力、物力、财力和其他资源实施该项目或项目群？
（3）项目在预定的预算和时间内按预定的技术标准完成的概率有多大？
（4）国防项目及项目群的结果能否满足客户要求？
（5）新发起的国防项目及项目群同企业正在实施的项目是否存在冲突？
（6）企业能否处理可能伴随国防项目及项目群产生的风险与不确定性？
2.资源配置与整合机制(www.xing528.com)
企业资源配置是指企业在生产、经营活动中，对当前拥有的各种资源在各种不同的生产和经营活动之间进行分配。如何优化企业项目与作业之间的资源分配，确保项目和项目群有效实施，是企业项目组合管理面临和必须解决的问题。
国防项目组合管理资源平衡机制，可以根据一定的原则对其进行分组管理，如组合管理、项目群管理，其目的就是为了实现项目之间资源的共享与平衡，优化资源的有效利用。
3.绩效考评与激励机制
组织的绩效考评是指评价主体利用其掌握的信息对评价客体运用一定的方法、程序、指标进行分析，进而对评价客体在一定时期内的行为、表现作出某种判断的过程。其目的在于通过考评对组织或个人的行为产生导向和牵引作用，从而保证和修正组织和个人的活动，确保企业战略目标的实现。
国防项目组合管理绩效考评应注意：
（1）当前业绩与长远发展的结合。既要关注企业、部门、个人当前表现，又要兼顾企业、部门、个人的未来发展，更要满足国防用户的需求，并对企业未来发展有推动作用。
（2）定量、定性考评相结合。考评体系应该将定量与定性考评指标相结合，公平合理地评价组织和个人。
（3）客观因素与主观努力相结合。考评要注意客观环境变化产生的影响和主观努力的情况，公平合理地评价组织和个人。
绩效考评是实施激励的基础，也是制定激励机制的依据。在柔性组织结构中，人员流动的增强，对人的激励显得尤为重要。在制定激励机制时，应侧重两个角度：短期利益与长期利益的均衡；激励机制和绩效考评指标的匹配。
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