自2016年5月1日起，我国全面推开营改增试点，将建筑业、房地产业、金融业、生活服务业全部纳入营改增试点范围。在原来征收营业税方式下，商业保理公司主要税种为营业税，按照营业收入的5%缴纳营业税。营业税属于价内税。营改增政策实施以后，按照营业收入的6%或3%缴纳增值税。增值税属于价外税，其营业收入为不含税价。C公司作为一般纳税人企业，按照营业收入的6%缴纳增值税。一方面，税率上升。保理融资利息及手续费收入由缴纳营业税改为缴纳增值税，增值税实际税率为5.66%，比原营业税税率5%提高了0.66个百分点。根据C公司每年6 000万元营业收入计算，税负增加39.6万元。另一方面，可抵扣进项税金项目少。具体有以下两点原因：一是在保理公司自身融资利息不允许抵扣的情况下，公司开展主营业务产生的营业成本基本没有进项抵扣项目；二是金融业其他可抵扣进项税项目较少，仅有少量固定资产采购、办公等营业费用。C公司在营改增后实际税负增加，公司运营成本增加，市场竞争力降低。在实施营业税阶段，天津、重庆、深圳等地的地税局为了给予保理公司一定的税收优惠政策，实行了营业税差额征收，避免重复征税，上海等地为保理公司提供了财政补贴。在实施增值税阶段，各地营业税差额征收政策不再实施，保理公司税赋明显上升。
在财务管理、账务处理方面，没有一套针对保理公司的明确、完整的政策或准则。随着市场经济的发展，会计准则与时俱进不断完善，已经形成了一套较为科学规范的会计体系。但是我国目前还未针对大多数具体行业制订细化的会计准则，导致账务处理中实务操作方面无章可循。传统金融行业如基金、证券、保险、银行，一些新兴的金融行业如融资租赁公司，均能在相应会计准则下进行账务处理，但目前保理公司的账务处理无章可循。保理公司尽管在税务方面的处理参照金融企业，但财务方面没有相关规则要求其适用金融行业的科目，缺乏相应账务处理依据。C公司成立之初执行一般企业会计准则，但是在后续银行融资授信及对外提供报表过程中发现，从财务报表无法看出企业保理融资放款余额及转让应收账款债权情况，财务报表无法真实、准确地反映公司财务状况。两年后公司开始改为执行金融企业会计准则，通过咨询、访问其他保理公司财务人员发现，各家账务处理、报表差别较大，未形成统一的会计处理方法，主要体现在发放保理融资款、应收账款债权处理上。一般企业会计准则下发放保理融资款的会计分录为“借：应收账款××万；贷：银行存款××万”，而金融企业会计准则下的会计分录为“借：发放贷款及垫款××万；贷：银行存款××万”。无论采用一般企业会计准则还是金融企业会计准则，转让到保理公司应收账款债权的会计核算都是难点，转让债权余额随着买卖双方交易的进行，一直在变动。由于保理公司、买方、卖方信息不对称，因此债权变动情况无法及时准确获得。2017年年末C公司确认债权余额29.93亿元，根据经验判断，这个数据实际存在±2%以内的差异已算是合理差异。由于缺乏统一政策指导，财务数据准确性受到影响，行业数据纵向、横向可比性不强，银行融资授信也复杂化。(www.xing528.com)
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