新军在治军上较多地保留传统方式，强调要恩威并重，宽严相济。袁世凯对于宽与严的关系认识较为深刻，他说，“治兵之道，宽与严而已”。所谓“宽”，即是“情志相孚，甘苦与共”；“严”，即“法立知惧，令出唯行”。但又要求严不能失之于残酷，宽不能失之于放纵，“傥以放纵为宽，势必纪律尽废，禁令不行，平居则殃害闾阎，临敌则违弃节度。譬之水懦易玩，触犯时多，迨不得已而为骈首之诛，而所伤实众，是欲示恩而转以贼恩矣。以残酷为严，势且鱼肉军士，草芥部卒，平居则无所措手足，临敌则疾视如仇雠。譬之蕰毒，既盈溃烂莫救，迨一旦激而成释甲之变，而倒行堪虞，是欲立威而反至损威矣”[205]。
新军将言语训导作为精神感化的重要手段，与军事训练置于同等重要的地位，认为，“训以固其心，练以精其技”[206]，不仅注重对一般士兵的训导，还特别加强了对将弁的思想训导，指出，“将则训以忠勇廉洁之大闲，兵则训以恭顺勤奋之要义，使皆知奉法循理，以端其志而正其趋”[207]。
（一）对将领的教育
“首在植品节而矢忠诚，任国家之事权，当思所以称职；受朝廷之禄位，当思所以图报。惟时时以尽瘁为心，事事以奉公为念。”[208]将领要能“爱民”和“自爱”，《图说》认为：“不知爱民者，不足与言公忠。不知自爱者，不足与励廉耻。”[209]所谓“爱民”，即与百姓交往要做到秋毫无犯，闾阎安堵。《图说》认为：“爱民适以自爱，利民实足自利。克敌制胜，良必由之。”[210]良好的兵民关系，不仅使平时“兵之所需种种具备，民之所有源源接济，兵无匮乏之忧，民有沾润之乐”[211]，在战时，“居民指示地利，或代探敌情，或导引前往，纵有败伤，或舁负以求其难，或隐匿以全其生，得力良多，受益匪浅”。《图说》特别提醒：“扰民适以自扰，害民实足自害。”[212]
为将领者，要有发源于内心的“忠义之勇”。《图说》认为，少壮时的“血气之勇”，求显达驱动下的“意气之勇”，威迫下的“勉强之勇”，均不可持久，而只有“忠义之勇”能够历久不渝，可以“上戴国恩”，“下亲族类”，如此则“自生仡仡桓桓，干城可寄矣”[213]。《图说》认为，“忠义之勇”方为大勇，“其存于中者，智勇沈雄而罔懈；其见乎外者，光明坦白而不欺。而后其下化之，亦莫不激发天良，明晓大义，尊尊而亲上，乐事而劝功。上率以忠诚，斯下应以忠义，理固然也”[214]。
为将者除忠勇之外，还必须勤于学习，“苟欲胜敌，安可无谋，苟欲能谋，安可废学”[215]。又说，“勇足以行其谋，谋足以运其勇，谋勇兼优，乃克有济”[216]。将领除要学习兵法谋略之外，还要兼习舆图、测算、格致、器械等西方军事理论或军事技术，以济其用。除接受一般营内教育外，还要进入大学堂进行系统化的学习，“肄业有成，试令作弁年满之后，再入大学堂卒业，学优复仕，阅历与学问并进”[217]。
（二）对哨弁的教育
《图说》认为，下级军官与士卒朝夕共处，“情志可以不隔，气息可以相通”[218]，“约束训练，临阵之奋身率先，发纵指示，皆惟尔是赖”[219]。士兵能否战场用命，关键看哨弁一级的军官能否尽到责任。他要求哨弁对士兵要像父兄子弟那样，“士卒之疾病，必躬亲省视，医药调护不徒藉手于夫役也；士卒之衣食，必悉心料检，寒燠饥渴不啻切身之恫瘝也；士卒之技艺，使之必精必熟，不至百密而一疏；士卒之器械，使之必洁必新，勿令匿瑕而含垢”[220]。对士兵中有小过者，“必从而委曲开导”。对于生事犯法者，则不能流于宽纵。《图说》特别强调在与士民杂居时，“教以公平而严杜骚扰，既禁恃众以滋事，尤禁挟刃以横行。士卒与人争讼，必秉公断其曲直，而力化偏私，既虑逞刁者侵陵不已，尤虑衔屈者报复相寻。士卒之出入起居，既当受之以节，士卒之性情举动，尤当察之于微”[221]。(www.xing528.com)
（三）对于士兵的教育
《图说》要求新军士兵应做到以下十点：一是“励忠义”，士兵应募，坐食厚饷，应知恩图报，“国不负尔，尔何负国”；二是“敬官长”，对官长平时要如“子弟之敬父兄”，战时应“卫之应如手足”；三是“守营规”，惟有各怀廉耻，谨守法度，才能“人莫不望而敬之，称而颂之”；四是“勤操练”，战阵攻守，练之必精，否则“技艺生疏，自取败亡”；五是“奋果敢”，要置生死于度外，整阵杀敌，果敢向前；六是“卫良民”，民为兵本，严禁侵扰；七是“怀国耻”，时时怀同仇之念，存雪耻之心，奉令出征，奋力图报；八是“惜军械”，平时对枪械加意爱惜，战时方能用之得力；九为“崇笃实”，做人忠诚老实，不欺下罔上；十为“知羞恶”，有过则改，振作向上。[222]要求士兵务将上面十条熟习于口，牢记于心，并与各项条规、训词实力奉行，交相切磋，互为劝勉。
袁世凯还根据训兵要旨，并借鉴曾国藩将训练要领和纪律条规写成歌谣的办法，编写了《劝兵歌》《行军歌》《侦探歌》《对兵歌》等韵文，令目兵牢记熟诵，这几首歌的内容基本涵盖了士兵日常需遵守的要点。如《劝兵歌》强调了七项注意事项：一要用心学操练，二要打仗真奋勇，三要好心待百姓，四莫奸淫人妇女，五莫见财生歹念，六要敬重朝廷官，七戒赌博吃大烟。[223]这些歌谣通俗易懂，朗朗上口，既便于学习记忆，又易于教授传播，用简单可行的手段向士兵灌输服从命令、听从官长的思想，从而达成思想上对士兵的控制。
张之洞对于自强军的思想教育也极为重视，在编练自强军时如此，在编练湖北新军时亦如此。他也学习曾国藩的方法，编成《劝勇歌》在军中传唱，要义为勉励士卒，如“自应爱身明道理，学成技艺报国家”。并大力宣传当兵为荣，同时严格纪律，严肃军令，兵勇不准擅自出营，[224]等等。
新军除重视思想教育外，仍将严明军律作为维持部队良好风气的重要手段。《图说》认为：“军律不明则赏罚倒置，纪律亦因而废弛，故节制之师，必以申明军律为第一义。”[225]新建陆军对军事纪律非常重视，专门制订了目兵须读的“简明军律”，列有违规当斩当罚二十条，军律规定：一、临阵进退不候号令及战后不归伍者斩；二、临阵回顾退缩及交头接耳私语者斩；三、临阵探报不实、诈功冒赏者斩；四、遇差逃亡、临阵诈病者斩；五、守卡不严敌得偷过及禀报迟误先自惊走者斩；六、临阵奉命怠慢有误戎机者斩；七、长官阵殁，首领属官援护不力，无一伤亡及头目战死本棚兵丁并无伤亡者悉斩以徇；八、临阵失火误事者斩；九、行队遗失军械及临阵未经受伤抛弃军器者斩；十、泄露密令，有心增减传谕及窃听密议者斩；十一、骚扰居民、抢掠财物、奸淫妇女者斩；十二、结盟立会、造言惑众者斩；十三、黑夜惊呼疾走乱伍者斩；十四、持械斗殴及聚众哄闹者斩；十五、有意抗违军令及凌辱本管官长者斩；十六、夤夜窃出离营浪游者斩；十七、官弁有意纵兵扰民者并斩；十八、在营吸食洋烟者斩；十九、夜深聚语、私留闲人、酗酒赌博、不遵约束及有寻常过犯者，均由该管官酌量情节轻重，分别插箭责罚；二十、凡兵丁犯法情节重大者，该管官及头目失察，均分别轻重参革、责罚、记过。简明军律刊发各营，使兵丁皆得持诵，并遴派执法营务处秉公纠查。[226]
除军律外，新军还订有其他方面的条规，如《兵丁日行规条》《操场暂行规条》《惩治逃兵律》《募兵律令》等，官兵必须遵行，违者必究，重则处斩，轻则责罚。如针对旧时军队军装号衣不整之弊，规定各营兵目因事赴市，必须穿着本营记号操衣，以便查街各官分别辨认。如不遵办，除随时拿办外，并将该管哨官责四十棍。又针对逃兵问题订《惩治逃兵律》，在各要道隘口派员设卡，严行稽查，如有逃兵被获解辕，以军法从严惩办。拿获逃兵的员弁，分别情形给赏。
自强军也有《洋操营务处禀定营规》，营规三十二条，规定极为细致，从营官要与洋教练和衷共济到排长要勤于训练等均有规定。对士兵则严禁结盟拜会、谣言惑众、抢劫财物、扰害民间。如有吸食洋烟、酗酒、赌博、口角、争殴，有一违犯者，“著插耳箭游营”[227]。营规还将枪械装具的保养纳入管理范围，规定枪械炮位要随时擦拭，不得锈蚀损坏。马匹应尽心喂养刷洗，“倘有瘦毙，从重罚办”[228]。
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