目前，我国水电行业增值税率为17%，县以下小型水力发电站（装机容量小于5万kW）税率为6%。和税制改革前还贷期2/3产品税免交的情况相比，还贷期税赋增加了几倍。同时，水力发电的增值税率同其他行业特别是火电的6%～10%相比，税率较高。水电站生产期运行成本低，抵扣少，而水电工程固定资产投资较大，但其建筑材料和设备的进项税额却不能抵扣，如果参照国外可以抵扣的政策，水电的增值税率可降低4%。水力发电节约了煤炭、石油、天然气等一次能源，建设水电同时完成了一次能源和二次能源的开发，能源开发的环节较少，应该实行优惠的增值税政策。
2.各种摊派的费用和重复征收的不合理税费(www.xing528.com)
目前，水电建设期间打入投资部分的各种税费主要有：矿产资源税和矿产资源补偿费，河道采砂管理费，水源工程补助费，水土保持费，施工场地内征收的税费（车船的使用税、车辆养路费、公路货运车辆附加费），水费，水库移民和征地征收的税费（耕地占用税、耕地开垦费、土地管理费和行政管理费、森林植被恢复费、土地使用税、公路建设附加费、建设用地粮食附加费、地方征收的以三税税金为基础的交通建设费附加），电站房屋建设中征收的税费（投资方向调节税、邮电配套费、中小学危房改造费、商业网点配套费、保证金、墙改基金、规划费、人防保证金、城市建设配套费、招待管理费、质检费、通信费、煤气改线管理费），属于摊派的费用（通航建筑物及以后的维护运行费，过木及下游河道整治费，建设期保安、消防等部门的业务经费、住宅、设备装备经费，银行、税务、邮电部门进驻现场住房，武警房屋及设备装备费，粉煤灰供应工程投用的电厂改造费及部分维护费，铁路物资转运等摊派费用，银行手续费、国际招标对外窗口手续费等），以上有很多税费都属于不合理税费，对于公益性水电这种清洁的、公益性的项目来说应予以免除。
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