NIH的根本任务就是合理使用政府下拨的经费，支持生物医学研究，因此需要根据其资助策略制定合理的基金分配方案。NIH的基本研究模式是院内、院外研究相结合。院内项目一般风险高、周期长且研究结果容易转移和传播；院外项目一般为自主创新的研究。这样既稳定了院内国际一流的研究力量，又保证了NIH对全美生物医学研究的宏观调控，支撑了美国生物医学研究在国际上的领先地位。NIH有规模庞大且成熟的项目资助和遴选体系，按照资助形式主要分为基金、合作协定与合同3种。其中基金是最主要的资助方式，支持各种与人类健康相关的研究项目和培训计划，一般由申请者个人提出资助申请，经评审通过后获得基金支持，资助年限1—5年，资助机构不参与项目的研究过程。合作协议则是事先由NIH对研究计划提出相应规定并发布特别申请须知，有时为了激发科学家对某些特殊领域的兴趣，还会发布项目声明。合同则是资助学术机构、非营利性或商业性机构就NIH感兴趣的特殊领域进行研究和开发。单一申请者的项目类似于中国自然基金委的面上项目或重点项目，资助强度为每年10万—25万美元；几个申请者联合的大课题类似于国家高技术研究发展计划（863计划）或国家重点基础研究发展计划（973计划），资助强度为每年50万—100万美元，两者资助期限均为3—5年。
在院内项目的评审中，属于非竞争性的机构资助，一般由NIH下属各研究所及研究中心制订计划和进行评估，而面向大学及科研机构的院外研究资助申请则需要通过竞争性的同行评议后才能予以资助。院外项目的评审，主要采取二级审评制度。第一阶段由NIH科学审批中心统一接收后，根据项目的内容、类型指定到1或2个NIH下属各研究所及研究中心，并同时指定由NIH院外的科学家组成的评审组对项目申请书进行评审。第二阶段由NIH各研究所及研究中心的国家顾问委员会执行，该委员会由院外科学家和公众代表组成。只有评审组和顾问委员会都愿意推荐的项目才可能得到资助。(www.xing528.com)
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