在“圣-卡洛斯”号之后，它的两艘姐妹舰—“圣-费尔南多”号与“圣-路易斯”号也被按照同等规格改装为拥有94门炮的三层甲板战舰。“圣-费尔南多”号于1765年建成入役，次年9月在处女航时护送一大批金银珠宝回到西班牙本土。据统计，“圣-费尔南多”号上载有3989160比索和其他货币（包括银币和金币），这在当时算是一笔不小的数字。
1779年，由于法国和西班牙对英国宣战，“圣-费尔南多”号加入路易斯·德·科尔多瓦的法西联合舰队。1780年8月9日，“圣-费尔南多”号跟随联合舰队截获了一支前往美洲支援英军的大型运输船队。这是西班牙海军在18世纪取得的最伟大的一次胜利，关于此次战斗的详细情况会在后面章节加以介绍。
“圣-费尔南多”号也参加了法西联合舰队在1782年直布罗陀附近对英国舰队的追剿，不过其作为后备舰队的一份子并未真正参战。此役结束后，“圣-费尔南多”号返回加的斯港，准备参加入侵牙买加的行动，但最终未能实施。1784年，“圣-费尔南多”号截获一艘瑞士籍的海盗双桅帆船“高亚娜-特洛伊”号（Goyana Troya），这也是该舰履历中俘获的第一艘敌船。
1786年，由于新舰服役造成的经济压力，西班牙海军部封存了一批老式舰艇，“圣-费尔南多”号就是其一。不过时间不长，到1790年时，“圣-费尔南多”号便在埃尔费罗尔港重新入役。该舰与其姐妹舰“圣-卡洛斯”号一样载炮数量被增至98门，但98门炮也成为它的最终状态，直到最后，“圣-费尔南多”号都未能像“圣-卡洛斯”号那样被二次升级为112门炮的一级战舰。同时船体也得到重建。重建后的船体尺寸为：甲板长203尺，龙骨长175尺，船宽57尺，平均吃水28尺6寸，最大吃水28尺10寸，轻载吨位为2047吨，满载排水量为3242吨。(www.xing528.com)
在与英国结盟期间，“圣-费尔南多”号一直驻扎在加的斯港。1796年，当西班牙与法国重新结盟对抗英国时，“圣-费尔南多”号被编入西班牙地中海舰队，参加了在地中海执行的一系列行动。1800年8月，“圣-费尔南多”号停泊在埃尔费罗尔港，曾被短暂解除武装，但很快又于次年4月20日重新恢复武装前往加的斯港。7月12日，“圣-费尔南多”号参加了阿尔赫斯拉斯之战，那场海战对于西班牙人来说是一次惨痛的战争。在战斗中，两艘圣安娜级112门炮一级战舰被摧毁，使得西班牙海军实力蒙受巨大损失。运气较好的“圣-费尔南多”号在战斗中全身而退，但受到了严重损伤。据资料显示，此战中“圣-费尔南多”号一共搭载了96门火炮（比额定少了两门）。
此后“圣-费尔南多”号被搁置在埃尔费罗尔，在1805至1806年曾接受大规模维修，但仍难以出海。就这样，“圣-费尔南多”号在1808年6月10日被迫退役。1815年，该舰被当作废木材变卖。
一艘西班牙双桅帆船的油画。其在西班牙语里被称为“Bergantín”，当时这种灵巧的小型帆船是海盗们的首选船只
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