这支庞大的联合舰队全部由划桨战舰组成，总共有212艘船。包括206艘加莱式战舰和6艘加利亚斯式战舰，共计搭载1815门火炮。其中6艘加利亚斯式战舰全部由威尼斯提供，其余的加莱式战舰分类如下：威尼斯舰队109艘，西班牙舰队55艘（含那不勒斯、西西里），热那亚舰队27艘，教皇舰队12艘，马耳他骑士团有3艘。舰队总司令为来自西班牙的唐·胡安，副司令有三人，分别为来自罗马教廷的马可·安东尼奥·科罗纳（Marcantonio Colonna），来自威尼斯的塞巴斯蒂安·费尼尔（Sebastiano Venier）和来自热那亚的吉安·安德烈亚·多里亚（Gianandrea Doria）。而整个舰队的划分也较为规整。全部212艘战舰一共被分为5支舰队，其中中央舰队由唐·胡安、费尼尔和科罗纳坐镇指挥，拥有62艘加莱式战舰和2艘加利亚斯式战舰；左翼舰队由威尼斯将领阿格斯迪诺·巴尔巴里戈（Agostino Barbarigo）指挥，拥有53艘加莱式战舰和2艘加利亚斯式战舰；右翼舰队由多里亚指挥，同样拥有53艘加莱式战舰和2艘加利亚斯式战舰；后备舰队由西班牙的唐·阿尔瓦罗·德·巴赞（Don Álvaro de Bazán）指挥，拥有30艘加莱式战舰；另有侦察舰队的8艘加莱式战舰。
此外，神圣同盟的舰队还搭载了为数众多的士兵。其中西班牙陆军8000人，威尼斯陆军5000人，教皇军1500人，日耳曼雇佣军5000人，意大利雇佣军5000人以及4000名其他以个人名义自愿加入神圣同盟的战士，总计28500人。这样规模的军队对于那时的欧洲来说已经是相当庞大的。
一幅反映神圣同盟舰队中央分舰队指挥官的油画。从左至右依次是：唐·胡安、科罗纳和费尼尔
再来看看奥斯曼帝国方面的力量。为了应对来自神圣同盟的挑战，苏丹塞利姆二世（SelimII）集结了一支规模比敌手还要庞大的舰队—总计206艘加莱式战舰、45艘快速排桨船（Galliot）和若干小型平底快船。舰队共载有741门火炮和31490名士兵。总司令为慕斯纳德·阿里·帕夏。与神圣同盟舰队相比，尽管在舰队规模人员上均占据一定的优势，但在火炮数量上却处于明显劣势。据史料记载，当时奥斯曼帝国舰队仍以弓弩作为主要武器——这说明在武器现代化程度上土耳其人已经显得明显落伍（尽管在整个勒班陀之战中火炮并未发挥主要作用）。(https://www.xing528.com)
慕斯纳德·阿里·帕夏（Muezzenade AliPasha，1522—1571）的画像。他是一名十分勇猛的战士，但在谋略上却有所欠缺
与神圣同盟舰队类似，奥斯曼帝国舰队也被分为中央、左翼、右翼、后备4支分队。其中中央舰队自然不必多说—由舰队总司令慕斯纳德·阿里·帕夏亲自坐镇，右翼舰队指挥为梅米特·苏力克·帕夏（Mehmet Sulik Pasha），左翼舰队指挥为大名鼎鼎的柏柏尔海盗头子乌尔奇·阿里·帕夏，后备舰队指挥则为阿穆拉特·德拉古特·莱斯（Amurat Dragut Rais）。这些指挥官都是为奥斯曼帝国立下赫赫战功的将领，在面对屡屡成为手下败将的欧洲军队时，心理优势自然不必多说。
乌尔奇·阿里·帕夏（Uluch Ali Pasha，1511—1587）的画像。他是一位经验丰富的海盗，勒班陀之战结束后成为奥斯曼帝国新的海军总司令
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