居民纳税人取得综合所得，平时采取预扣预缴，当年度预扣预缴的税额和年度应纳的税额不一致，就必须办理年终汇算清缴。纳税人取得经营所得，由纳税人在月度或季度终了后15日内，向经营管理所在地主管税务机关办理预缴纳税申报，由于经营所得是按年计算个人所得税的，年终必须进行汇算清缴申报纳税。纳税人可以委托扣缴义务人或者其他单位和个人办理汇算清缴。[1]
（一）取得综合所得需要办理汇算清缴的纳税申报
前面阐述过居民纳税人取得的工资、薪金所得，一般由扣缴义务人按累计预扣法扣缴。如果居民纳税人只有工资、薪金一项所得，没有其他所得，并且六项专项附加扣除信息正确地提供给扣缴义务人的，则纳税人不用进行汇算清缴自行申报。但若取得综合所得且符合下列情形之一的纳税人，应当依法办理汇算清缴申报。
1.办理汇算清缴纳税申报的情形
（1）从两处以上取得综合所得，且综合所得年收入额减除专项扣除后的余额超过60，000元；
（2）取得劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得中的一项或者多项，且综合所得年收入额减除专项扣除的余额超过60，000元；
（3）纳税年度内预缴税额低于应纳税额；
（4）纳税人申请退税。
2.对居民纳税人的综合所得汇算清缴应纳税额的计算
根据新法，居民纳税人的应纳税所得额，是以每一纳税年度的收入额减除费用60，000元及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额。
具体计算公式如下：
全年综合所得的应纳税所得额＝纳税年度的收入总额-60，000-专项扣除-专项附加扣除-其他扣除；
年终汇算清缴应交（退）税额＝（全年综合所得的应纳税所得额×税率-速算扣除数）-（全年可以减免的税额-累计减免税额）-累计已预扣预缴税额。
【例1】 2019年王平全年工资薪酬为180，000元，“三险一金”为13，800元，专项附加扣除23，000元（赡养老人费用12，000元、小孩教育费用11，000元），3月份取得劳务报酬所得20，000元，4月份取得稿酬所得3000元，转让特许权使用费所得9500元，以上所得全年已经预扣预缴税额7000元。没有可减免的税额。试根据王平全年的综合所得计算其全年应交税额并迸行汇算清缴。
全年综合所得应纳税所得额
＝（180，000-13，800-12，000-11，000-60，000）＋（20，000＋9，500）×（1-20%）＋3000×（1-20%）×70%
＝108，480（元）；
全年应交税额＝108，480×10%-2520＝8328（元）；
汇算清缴应补交税额＝8328-7000＝1328（元）。
3.办理汇算清缴纳税申报的时间、地点和申报材料
需要办理汇算清缴的纳税人，应当在取得所得的次年3月1日—6月30日，向任职、受雇单位所在地主管税务机关办理纳税申报，并报送“个人所得税年度自行纳税申报表”。纳税人有两处以上任职、受雇单位的，选择向其中一处任职、受雇单位所在地主管税务机关办理纳税申报；纳税人没有任职、受雇单位的，向户籍所在地或经常居住地主管税务机关办理纳税申报。(www.xing528.com)
纳税人办理综合所得汇算清缴纳税申报的，应当准备与收入、专项扣除、专项附加扣除、依法确定的其他扣除、捐赠和享受税收优惠等相关的资料，并按规定留存备查或报送。
纳税人取得综合所得办理汇算清缴纳税申报的具体办法，由国家税务总局另行公告。
（二）取得经营所得的汇算清缴纳税申报
1.取得经营所得的纳税申报办理的情形
纳税人取得经营所得且按年计算个人所得税的，由纳税人在月度或季度终了后15日内，向经营管理所在地主管税务机关办理预缴纳税申报，年终必须进行汇算清缴纳税申报。
个体工商户业主、个人独资企业投资者、合伙企业个人合伙人、承包承租经营者个人及其他从事生产、经营活动的个人取得的经营所得，包括以下情形：
（1）个体工商户从事生产、经营活动取得的所得，个人独资企业投资者、合伙企业个人合伙人来源于在我国境内注册的个人独资企业、合伙企业从事生产、经营取得的所得；
（2）个人依法从事办学、医疗、咨询及其他有偿服务活动取得的所得；
（3）个人对企业、事业单位承包经营、承租经营及转包、转租取得的所得；
（4）个人从事其他生产、经营活动取得的所得。
2.办理经营所得自行纳税申报的时间、地点和申报材料
纳税人取得经营所得，按年计算个人所得税，由纳税人在月度或季度终了后15日内，向经营管理所在地主管税务机关办理预缴纳税申报，并报送“个人所得税经营所得纳税申报表（A表）”；在取得所得的次年3月31日前，到经营管理所在地主管税务机关办理汇算清缴，并报送“个人所得税经营所得纳税申报表（B表）”；从两处以上取得经营所得的，选择向其中一处经营管理所在地主管税务机关办理年度汇总申报，并报送“个人所得税经营所得纳税申报表（C表）”。
此外，要注意取得经营所得的个人，没有综合所得的，计算其每一纳税年度的应纳税所得额时，应当减除费用60，000元、专项扣除、专项附加扣除及依法确定的其他扣除，可以在办理汇算清缴时减除。
经营所得汇算清缴的计算公式为：
汇缴应补退税额＝全年应纳税额-累计已缴税额；
全年应纳税额＝全年应纳税所得额×税率[2]-速算扣除数。
【例2】 纳税人黄娜没有其他经济来源，2019年办了一个超市，假定2019年全年实现利润300，000元，她个人没有从超市开支工资、薪金。她2019年有专项附加扣除项目，赡养老人费用8000元，小孩教育费用12，000元，首套房屋贷款利息12，000元。全年预缴税额21，000元。试计算黄娜2019年汇算清缴时应缴或应退的个人所得税。
2019年黄娜的经营所得＝300，000-60，000-8000-12，000-12，000＝208，000（元）；
2019年黄娜应交的个人所得税＝208，000×20%-16，920＝24，680（元）＞21，000（元）；
2019年黄娜应补缴的个人所得税＝24，680-21，000＝3680（元）。
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