高校财务管理的改革首要的是改革“高度集中管理”的体制。因为在改革的新形势下，这种管理的模式已日益显露出其自身不可克服的弊端：
第一，高度集中的统一管理，管得太多，统得太死，基层缺乏必要的自主权，使责、权、利脱节，挫伤了他们生财理财的积极性，抑制了整个高校的活力。第二，在高度集中管理体制下所制定出来的政策、法规和制度，往往“一刀切”，“宜粗不宜细”，虽然注意了普遍存在的问题，但往往忽略各单位具体的实际情况，缺乏灵活性和应变能力。一旦特殊情况出现，很难及时采取有效的措施加以解决。有时还容易被少数人和单位钻政策和制度的空子。第三，在高度集中、统收统支、平均分配的制度下，人们手捧铁饭碗，丧失了主人翁的责任感。第四，由于实行高度集中的统一管理，学校财务部门整天忙于记账、算账和报账等事务性工作，不可能有时间和精力来调查学校财务情况，研究制定系统的财务管理政策、制度和计划，实际上失去了财务管理的重要职能。另外，由于管得太多，必然会出现一些管不了或管不好的情况，也容易导致官僚主义和主观主义的产生。要克服以上弊端，必须改革与整个经济改革不协调的高校财务“高度集中管理体制”，遵循商品经济的规律，根据责、权、利相结合的原则，在全面实行经济责任制的基础上，对于一些具备了一定条件的基层单位，适当下放一部分财务管理权限，改高度集权为简政放权，改高度集中管理体制为分级管理体制。现在有不少高校在这方面进行了一系列改革尝试，取得了可喜的成绩，可以进一步总结推广。(www.xing528.com)
改革并不都是一帆风顺的，尝试往往会遇到波折。近几年来，不少院校在财务管理改革过程中，为了调动基层单位理财的积极性，改革高校财务高度集中管理体制，适当下放了一部分财权，有的还实行了“分级管理体制”。实事求是地说，大多数学校改革效果是好的，但也有少数院校由于不具备下放财权的条件，造成资金分散、管理混乱，个别基层单位甚至出现擅自在银行开设账户，侵占学校权益，冲击规章制度，违反财经纪律的现象。这是高校财务管理改革中的逆流。为了保证高校财务改革的健康发展，国家教委颁发的《关于适当集中财权加强财务管理的意见》，提出了“适当集中财权”的要求和下放财权必须具备的一系列条件。这是为了保证改革开放继续深入和简政放权的严肃性，使高校财务管理工作做到放而不乱，有条不紊。因此，这里提出的“适当集中财权”并不是要回到高校财务高度集中管理体制的老路上去，而是要求高校稳妥而有步骤地进行这方面的改革。为此，《关于适当集中财权加强财务管理的意见》中还指出：“根据当前实际情况和管理要求，各院校原则上实行‘一级核算，二级管理’的财务管理体制，规模较大而且具备条件的院校也可以实行‘二级核算，二级管理’的财务管理体制。”
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