欧洲殖民统治时期，东南亚地区各国相互移民现象很少。此时，该地区的移民主要来自中国、欧洲和中东各国。随后的日据时期，欧洲移民被迫离开东南亚，很多华侨也回到中国或到其他国家避难。20世纪50—60年代，除了东南亚的一些华侨华人因排华等原因回到中国外，东南亚地区的国际移民，主要是随欧洲殖民者返回欧洲或前往澳大利亚，这些国际移民大多与殖民者有各种联系，同时，随行的有少部分的留学生和劳工。这时期的东南亚国际移民还包括相当数量的留学生，他们主要是在科伦坡计划（Colombo Plan）资助下前往欧美各国，包括部分华人学生。[17]同时，美国还招募泰国劳工为美国的军事项目服务，随后又派遣这些劳工前往南越。在印尼，荷兰殖民者大批离去，随行携带一部分在印尼时的雇员，他们大多拥有一技之长并且信奉基督教，被带往欧洲各国集中投资和殖民活动的地区。[18]这些人中，有相当多的华人。
1960年1月20日，《中华人民共和国和印度尼西亚共和国关于双重国籍问题的条约》生效。根据条约规定，华侨凡属于双重国籍者，均按自动原则选择一种国籍。一批印尼华侨选择中国国籍后，陆续返回中国。1965年9月30日，印尼雅加达发生了由苏加诺（Bung Sukarno）总统卫队营长翁东（Untung）上校领导的军事政变，试图从右派手中夺取陆军领导权。时任印尼总统的苏加诺由于政治立场倾向社会主义阵营，被支持西方的苏哈托（Haji Suharto）推翻。苏哈托随即在全国策动反共大清洗，导致大量华人被当作共产党员处决，大量华人被迫离开印尼，到海外生活。
此外，印尼、马来西亚、泰国、菲律宾和文莱的一些穆斯林教徒，离开居住国前往麦加朝圣，少数人或留居中东地区。(www.xing528.com)
1945—1970年，东南亚地区尚未形成大规模区内移民的主要原因，在于东南亚各国相继独立后，重新划定边界，加强管理，减少了区域内人口的流动。同时，各国经济发展水平较低，交通和移民成本较高，容纳移民的空间有限。加之广播、电视和其他大众媒体的传播不畅，使得东南亚各国人民对外部了解有限，移民意愿不强。
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