新建成的三十艘军舰中的大部分被弃置一旁，从未出航过，从舰尾腐烂到舰头，从外部甲板腐烂到火炮甲板，舰上的钉子也碎成粉末，舰上的木条纷纷掉落水中，最后碎成木屑。腐朽不堪的舰体极易引发火灾，舰体两侧被涂满石灰，以此来遮盖舰体上无处不在的漏洞并起到防水效果。三十艘全新的英格兰军舰甚至比刚从战场上归来的旧军舰更破败不堪。海军委员会曾向英格兰政府报告，几艘崭新的英格兰军舰有在停泊处直接沉没的危险。
由于尚未镀铜的军舰外部极易被腐蚀，所以需要时常清理。具体来说，就是需要烧掉军舰舰底长期沉积的海泥、莎草、贝类和海藻。由木柴和芦苇点燃的火苗可以轻易融化舰体表面的沥青涂层，以及舰底的普通附着物。清扫完成后，舰体将会再次被涂上沥青。清扫军舰的资金本该出自议会的六十七万英镑拨款，但拨款落入了海军财政大臣的口袋。议会修订的严格条款、查理二世反复强调的指令、英格兰财政大臣下达的命令都没能确保议会拨款花到实处。这就是1685年2月查理二世去世前皇家海军的实际状况。查理二世决定在约克公爵詹姆斯·斯图亚特的协助下亲自管理皇家海军。约克公爵詹姆斯·斯图亚特将退居温莎的塞缪尔·佩皮斯官复原职。查理二世统治末期和詹姆斯二世统治初期，皇家海军没有丝毫起色。1686年1月，皇家海军舰队依旧衰败不堪。九万英镑的拨款被用来修缮英格兰军舰，但这笔钱不过是杯水车薪。仅有不到四分之一的军舰在重新整修后达到出航要求。蒙茅斯叛乱发生时，皇家海军竟然无法组建起一支舰队。被闲置的三十艘全新军舰没有得到任何修整，皇家海军仓库空空如也。显然，如果不采取强硬措施，皇家海军很快会彻底消失。詹姆斯二世既不是一个伟大的军事指挥者，也不是一个睿智的君主。但詹姆斯二世正式即位后，愿意采取措施拯救皇家海军舰队。虽然我们不能把全部功劳归于詹姆斯二世，但他确实做了重新整顿皇家海军舰队的决定。詹姆斯二世任命合适的人选后，开始全力以赴地支持手下的工作。(www.xing528.com)
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