DNA的提取方法较多,如酚/三氯甲烷/异戊醇法、尿素提取法、氯化锌法、三乙醇月桂基硫酸盐法、碘化物法、直接煮沸法等。
以下以酚/三氯甲烷/异戊醇法为例:
酚/三氯甲烷/异戊醇法:通过酚-三氯甲烷混合物萃取DNA溶液中的蛋白质类有机物质,而保留DNA于水相溶液中,适用所有生物检材。其提取DNA量比Chelex100法和无机盐提取法多,且DNA分子结构完整。
(1)样本:人外周静脉抗凝血。分别采集外周静脉血5 mL,2%乙二胺四乙酸二钠(EDTA)抗凝,待用(要求采血至分离白细胞间隔时间在室温下放置不超过2 h,4℃放置不超过5 h,避免白细胞自溶)。(www.xing528.com)
(2)仪器设备与试剂:①采用1.5 mL离心管及最高转速13 000 r/min的微型高速离心机;②5~100℃可调、误差小于1℃的56℃干热器;③10μL、100μL、1 000μL可调、误差小于1μL的移液器;④1×SSC溶液,0.2 mol/L和2 mol/L乙酸钠,10%SDS,20 mgL/mL蛋白酶K,酚∶三氯甲烷∶异戊醇(25∶24∶1);⑤1×TE溶液,包括70%和100%乙醇。
(3)步骤:①采集血样放入含有EDTA真空管,使用前充分混匀。取1.5 mL带盖微型离心管吸700μL血样冷冻保存备用。②37℃培育冷冻血样,加1×SSC800μL混合。离心,13 000 r/min,1 min,弃上清液。③加1.0 mL1×SSC振荡,离心,13 000 r/min,1 min,弃上清液。注意避免触动沉淀物团。④加375μL0.2 mol/L乙酸钠,振荡使沉淀物悬浮,加10%SDS 25μL和蛋白酶K 5μL,旋涡振荡,56℃培育1 h。⑤加等体积的酚/三氯甲烷/异戊醇,旋涡振荡30 s。⑥微型离心机上2 000 r/min,离心2 min。⑦仔细吸取水相转移到另一新的1.5 mL微型离心管。注意避免吸到在分界面上积聚的变性蛋白,弃去剩余酚和变性蛋白。⑧加1μL100%冷乙醇,倒转混匀,置于-20℃冰箱15 min。⑨加180μL 1×TE,旋涡振荡使沉淀物团散开,56℃孵育10 min。加入20μL 2 mol/L乙酸钠,倒转混合5 s。⑩加500μL100%冷乙醇。轻轻地混匀,使之成为均一溶液。2 000 r/min离心5 min。弃去上清液。⑪用1 mL室温70%乙醇清洗沉淀物团。2 000 r/min离心5 min。用微量移液器尽可能移去上清液,切勿打乱沉淀物团。⑫真空干燥沉淀物团。此步骤应在约5 min完成,不能过干,避免DNA不再溶解。⑬加200μL1×TE混合,56℃孵育过夜。次日晨,旋涡振荡10 s。
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