Y库即Y-DNA数据库或Y染色体数据库，主要是指Y-STR数据库。如果单纯从Y-DNA来分析，人类家系的总数约1 000万，全中国家系的数量在100万左右。这是Y库数据容量的总体规模。
Y库是新一代的DNA数据系统，国内外陆陆续续在开展建库工作。但因为外国的姓氏产生时间晚，姓氏传递与Y染色体的联系远不如中国紧密，在YDNA水平很难显示出不同姓氏人群间有本质差异。所以，国外的Y库基本是分型库，储存的是Y-DNA的自然分型。基于我国的实际情况，Y库强化了姓氏的检测和检索功能，因而有更多的现实需求，所以中国Y库的建设走在了世界的前列。
Y-STR家系排查法目前多应用于农村，特别是以家族式群居的自然村落，以此为基础构建乡村级别的Y库，进而构建省市地区和全国的Y库。我国是一个多民族国家，56个民族有着各自的民俗、风情、生活习惯和聚居地。特别是一些少数民族，对外交流少，民族特征明显，在民族的演化过程中有很强的父系群体遗传特征。具有这些特征的居住人群，遗传关系相对稳定，适合构建Y-STR基础数据库。(www.xing528.com)
如何向上溯源，且使划分的家系少而精，同时还能做到全面、完整，这是一个重点，也是一个难点。可以设想，以村为单位，对村落家系进行统计，同时对迁入和迁出人员进行备案，然后交由办理人员进行梳理，绘制出全面准确的家系图，然后层层递进，最终得到某个地区总的家系分布图。在上述基础上对每个家系选取1～2名代表性人员进行采样，然后检测Y-STR分型。
Y-STR基因座的突变率与常染色体STR基因座接近，一般为0.1%～0.65%，因此，在建立Y-STR数据库时要充分考虑突变带来的问题。对于入库个体的背景资料和亲缘关系要尽可能详尽。另外，对于改姓、过继、入赘甚至妻子出轨的情况要详细记录，以免在家系中追查嫌疑人时遗漏，导致检测失败。
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