基因多样性在群体遗传学中的应用及Y-DNA检测

基因多样性是群体遗传调查中用来显示一个种群中基因的多样性，或者说是基因库的丰富程度。累积基因多样性（total gene diversity，TGD）采用直接计数法计算各个基因座的等位基因频率（gene diversity，GD），各基因座等位基因与单倍型检出频率采用直接计数法，等位基因多样性及单倍型多样性GD值按公式GD=n（1-∑Pi2）/（n-1）计算（式中n为样本数，Pi为基因频率或单倍型频率）。对于Y染色体来说，GD值即等于个体识别能力和非父排除率，常用Y-STR基因多样性如表3-1所示。

表3-1　常用Y-STR的基因多样性（GD，n=2 000）

基因频率是某种基因在某个种群中出现的比例。基因型频率是某种特定基因型的个体占群体内全部个体的比例。前者是某基因个体数占全部基因数的比例，后者是某基因型个体数占群体总数的比例。相关计算：

（1）设二倍体生物个体的某一基因座上有两个等位基因A和a，假设种群中共有N个个体，而AA、Aa、aa三种基因型的个体数分别为n1、n2、n3，那么种群中A基因的频率和AA基因型的频率分别是：(www.xing528.com)

①A基因的频率=A基因的总数/（A基因的总数+a基因的总数）=（2n1+n2）/2N或n1/N+n2/2N；

②AA基因型的频率=AA基因型的个体数/该二倍体群体总数=n1/N。

（2）基因频率与基因型频率的计算关系，由上述①②可推得：

A基因的频率=n1/N+1/2×n2/N=AA基因型的频率+1/2Aa基因型的频率。