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计算群体个体的近交系数和加性遗传相关性

时间:2026-01-24 理论教育 峰子 版权反馈
【摘要】:例11.1现有7 个个体组成的群体,其系谱记录见表11.1,试运用INBREED 过程计算每个个体的近交系数和个体间的加性遗传相关。例11.1 中,5 号个体的近交系数为0.125,3 号和4 号个体潜在后代的近交系数为0.125。从个体近交系数的结果中可以看出,1—4 号个体的近交系数都为0,5—7号个体的近交系数分别为0.125、0.250 0 和0.281 3。图11.3例11.1SAS 程序图

例11.1 现有7 个个体组成的群体,其系谱记录见表11.1,试运用INBREED 过程计算每个个体的近交系数和个体间的加性遗传相关。

表11.1 7 个个体的系谱数据表

图示

SAS 程序如图11.1 所示。

图示

图11.1 例11.1SAS 程序图(1)

输出结果为:

1.个体近交系数

本部分结果输出了近交系数矩阵,然后再给出群体中每个个体的近交系数。近交系数矩阵中对角线上的第i 个元素为i 的近交系数,非对角线上第i 行第j 列的元素为个体i 和个体j潜后代的近交系数。例11.1 中,5 号个体的近交系数为0.125,3 号和4 号个体潜在后代的近交系数为0.125。从系谱结构中可以看出,5 号个体就是3 号和4 号个体的后代。(https://www.xing528.com)

从个体近交系数的结果中可以看出,1—4 号个体的近交系数都为0(即为非近交个体),5—7号个体的近交系数分别为0.125、0.250 0 和0.281 3。

SAS 程序如图11.2 所示。

图示

图11.2 例11.1SAS 程序图(2)

2.个体间的加性遗传相关系数

本部分结果输出了个体间的加性遗传相关系数,1 号和3 号的加性遗传相关系数为0.5,1 号和4 号的加性遗传相关系数为0.5,1 号和5 号的加性遗传相关系数为0.5,1 号和6 号的加性遗传相关系数为0.75,1 号和7 号的加性遗传相关系数为0.625,以此类推。

SAS 程序如图11.3 所示。

图示

图11.3 例11.1SAS 程序图(3)

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