元代官府藏书的机构，大多数是皮藏和刻印结合在一起的。它既是藏书的机构，也是刻印出版的场所。钱大昕《补元史艺文志序》中说：“元起朔漠，未遑文事。太宗八年六月，始用耶律楚材言，立经籍所于平阳，编集经史。世祖至元四年，徙置京师，改名宏文院。九年置秘书监，掌历代图籍，并阴阳禁书。”[11]
经籍所，太宗八年（1236）六月成立，是当时印刷出版中心，也是中央藏书之所。至元四年（1267）从平阳（今山西临汾）迁往大都，改名宏文院，以马天诏知院事。世祖至元九年（1272）置秘书监，“秘书之官，始由两汉，爰至我朝，收古今之图籍，贮之秘府”[12]。可见秘书监是藏书的机构。秘书监，秩正三品，设卿、太监、少监、监丞、典簿、令史、知印、奏差、译史、通事、典书、典史等。属官则有著作郎、著作佐郎、秘书郎、校书郎、辨验书画直长等。
据《秘书监志》记载，秘书监藏书只有书的数量，多少部、多少册，没有书的名称、作者和卷数，是一本图书清册，不是图书目录。
在库书：
先次送库书：
后次发下书：
续发下书：
另外，收到而未入库的图书数：
书画：二千零八轴；
法书：四百八十二轴；
法书：八十三轴；
手卷：三百九十九卷；
内府取：三十五卷；
今在库：三百六十四卷；
名画：一千五百五十六轴；
名画：一千一百五十五轴；
内府取：八十三轴；
今在库：一千零七十二轴；(www.xing528.com)
手卷：三百七十一卷；
内府取：三十卷；
今在库：二百三十七卷；
看册：七帙。[13]
以上秘书监所藏的书画，多是金、宋流传下来和四方购纳的古书名画，专供皇帝阅览。值得注意的是书中记录了阿拉伯文的数学书籍四十三部，[14]这是很可贵的。
此外，顺帝至正（1341〜1367）中有危素撰的《史馆购书目录》、毛文在撰的《上都分学书目》，这两种目录，都已失传。
兴文署，初建于至元十一年（1274），据《秘书监志》载：“至元十一年十一月初七日，太保大司农奏过事内一件。兴文署掌雕印文书，交属秘书监。”至元十三年（1276）并入翰林院。至元二十四年（1287）与国子监皆屈集贤院。[15]至元二十七年（1290）正月，复立兴文署，掌经籍版及江南学田钱谷。[16]兴文署设官三员、令一员、丞三员、校理四员、楷书一员、掌记一员、镌字匠四十名、作头一、匠户十九、印臣十六。[17]元代官刻书，首推兴文署。
奎章阁也是官府藏书、刻书的机构。天历二年（1329）三月，建立于西宫兴圣殿西廊，分南、中、北三间。阁官署衔，初名奎章阁学士，隶东宫属官，后升为奎章阁学士院；置大学土五员，井知经筵事，侍书学士二员、承制学士二员、供奉学士二员，并兼经筵官幕职；置参书二员、典箴二员，并兼经筵参赞官，照磨一员；内掾二名，内二名兼检讨，宣使四名、知印二名、译史二名、典书四名；属官则有群玉内司，置监群玉内司一员、司尉一员、亚尉二员、佥司二员、典簿一员，令史二名、典吏二名、司钥二名、司膳四名、给使八名。
创立奎章阁的目的，据虞集撰的《奎章阁汜》中所说：
大统既正，海内定一，乃稽古右文，崇德乐道……备燕闲之居，将以渊潜遐思，缉熙典学。乃置学士员，俾颂乎祖宗之成训，毋忘乎创业之艰难，而守成之不易也。又俾陈夫内圣外王之道，兴亡得失之故而以自儆焉。[18]
奎章阁成立以后，天历二年（1329）九月，敕翰林国史院官同奎章阁学士采辑本朝典故，偏著《经世大典》。至顺元年（1330）二月，命奎章阁阿邻帖木儿、忽都鲁都儿迷失等译蒙古语所记典章为汉语，由赵世延、虞集等任纂修。可见奎章阁的职务，除藏书以外，还有编辑，翻译、校勘、出版图书的任务。
1.群玉内司
群玉内司，属奎章阁学士院。天历二年（1329），秩正三品，掌奎章阁图书、宝玩。顺帝元统年（1333〜1335）间并入艺文监。
2.艺文监
艺文监，是主管内府书籍、译作、出版的机构。天历二年（1329）置。秩从三品，设太监检校书籍事、少监同检校书籍事、监丞参检校书籍事各二员，典簿、照磨各一员，令史四名、典吏二名，别设监书博士二员，学鉴辨书画。授经郎二员，掌训教勋旧贵戚大臣子孙。《元史·百官志）曰：“艺文监专以国语敷译儒书，及儒书之合校雠者，俾兼治之。”艺文监下又设：（1）艺林库：天历二年（1329）置。秩从六品，掌贮藏书籍。设提点、大使、副使各一员，司吏二名，库子一名。（2）广成局：天历二年（1329）置。秩七品，掌传刻经籍及印造之事。设大使、副使各一员，直氏二员，司更二名。
顺帝至正元年（1341），奎章阁改为宣文阁。至元六年（1340）艺文监改为崇文监，后隶属翰林国史院。
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