元代官府藏书的主要来源，除承袭金代遗留的典籍外，大部分是从南宋灭亡后取得的。元朝统一中国以后，对图书的征集非常重视，元世祖至元十二年（1275）二月，元丞相伯颜挥师打败贾似道统领的宋军后，得“督府图籍符印”[3]。九月，以玉昔帖木儿为御史大夫，括江南诸郡书版和临安秘书省《乾坤宝典》等书。至元十三年（1276）二月，伯颜受宋降后，遣内侍王埜，收宫中图籍、宝玩等物，又命焦友直“括宋秘书省禁书图籍”[4]。三月，伯颜人临安，又派郎中孟祺没收秘书省、国子监、国史院、学士院、太常寺图书、祭器、乐器等物。这年冬天十月，两浙宣抚使焦友直以临安经籍、图画、阴阳秘书来上，由海道运到大都。
当伯颜命董文炳人临安，封库藏、收礼乐器及诸图籍时，董文炳说：“国可灭，史不可没。宋十六主，有天下三百余年，其太史所记，具在史馆，宜悉收以备典礼。”[5]当时收得宋史及各种注记共五千余册，归之国史院。元世祖至元十五年（1278）四月，集贤大学士许衡建议遣使到杭州等处取官府书籍版刻至京师，[6]由兴文署掌管。
此外，元代中央机构官吏，还广收各地图书，如湖南宪使卢挚收江南诸郡四库精善本书，运至大都，藏于兴文署。[7]武宗大德十一年（1307）也派遣使臣到四方收集经书。[8]顺帝至正三年（1343）开始修撰宋、辽、金三史时，因文献不足，又下诏求购遗书，求书的重点也在江南。至正六年（1346）规定，凡献书的都给以官职。当时，松江庄肃，字恭叔，号蓼塘，家中藏书数万卷，且多手抄书，自经史子集、山经地志、医卜方技、稗官小说都有，书目以甲、乙分十门。至正年间，朝廷开同修宋、辽、金三史，诏求遗书，特差危素至其家选购书籍。[9]此外，顺帝还派遣司书官到东南寻求私藏的汉籍，仅四五年间，收到遗书三十多万卷。(www.xing528.com)
元代官府藏书，经过接收前朝遗书和收罗四方典籍，特别是收集到南宋的刻印书版。官府藏书的数量，虽比不上宋代，但也很可观。只是由于不善于管理，又没有组织校勘整理，正如《秘书监志》所说：“自至无迄今，库无定数，题目简秩，宁无紊乱。”[10]因秘书监没有详细书目，所以藏书的情况也无法查考了。
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