顺治是清军入关后的第一位皇帝，他六岁登极，年轻有为，志向高远，尤其是朱元璋风格的反腐措施，奠定了大清两百六十多年的基业。公元1661年，顺治驾崩，年仅二十四年，把一个井然有序的庞大帝国留给另一位更伟大的少年天子——康熙。康熙即位也只有八岁，由索尼、苏克萨哈、遏必隆和鳌拜四大臣辅政。鳌拜虽然身居四辅臣之末，但是他野心勃勃，根本不把年幼的康熙放在眼中。经常在康熙面前大呼小叫，训斥群臣，有时故意拒绝执行康熙的旨令。康熙亲政之后，鳌拜仍旧视他如无物，擅权决杀、结党营私，骄横无比。甚至有可能包藏祸害康熙的叛逆之心。有一回，康熙去探视鳌拜，鳌拜竟然在卧席下放着一把利刃。被康熙的侍卫搜出之后，场面一度剑拔弩张，最后还是康熙镇定自若，化解了一场危机。
鳌拜气焰熏天，任何人都受不了，更别说康熙这么一个具有雄才大略的皇帝了。所以康熙亲政之后，整顿吏治的最主要任务是铲除权臣，巩固自己的地位。公元1669年，十六岁的康熙与亲信索额图合谋，生擒鳌拜，清除鳌拜集团的残余势力。
灭了鳌拜之后，“三藩”、河务、漕运又成了康熙的当务之急，把惩贪重点放在对官员的思想教育上，多次强调当官要有官德，廉洁自律。
平三藩、收台湾，康熙奋斗了十一、二年，终于在公元1683年完成全国的大一统。地位巩固了，政权稳定了，康熙开始把目光转向“察吏安民”上。康熙的治国理念与老爹顺治如出一辙，都强调惩贪的重要性。——“治国莫要于惩贪”、“治天下以惩贪奖廉为要务”。
在这之后被揭发第一起重大贪污案是公元1684年的宜昌阿、金隽侵吞逆产案。尚之信是平南王尚可喜的儿子，在吴三桂叛乱期间拥兵自重，成了一株在风中摇摆不定的墙头草。结果公元1680年尚之信被绑送北京，赐死，搜刮的家产也没入官府，康熙把尚之信的家产交给刑部侍郎宜昌阿、广东巡抚金隽看守。万万没有料到，康熙这一决定是让两只馋猫去看守鱼库。
宜昌阿、金隽抵不住尚之信府中金银珠宝的诱惑，干脆一不做二不休，合谋舞弊，私吞了部分财宝，并收受平南王府参将沈上达的贿赂，累计高达八十九万两白银。又惧怕事情败露，就杀人灭口，干掉沈上达。
沈上达之死惊动了康熙，康熙派刑部侍郎禅塔海审理此案。禅塔海又收取了宜昌阿和金隽的贿赂，假称沈上达属自缢而亡。禅塔海还发誓说，要是沈上达死于其他原因，自己愿领死罪。妄图以此来蒙骗年轻的皇帝。
但是康熙的眼睛是雪亮雪亮的，马上下令将禅塔海拘禁，与宜昌阿、金隽等人一并严加议处。最后议政王大臣会议一致通过，宜昌阿、金隽斩立决，禅塔海革职。缴获的所有赃款拨给户部，充当军饷。
在严查宜昌阿、金隽贪污案的同时，御史钱珏弹劾山西巡抚穆尔赛属官征收的火耗甚重，结果又曝出了一起贪污案。火耗是什么回事？万历首辅张居正变革期间，推行一条鞭法，把百姓上交的碎银重新熔化，铸成银锭，纳入国库。在重铸时必定有所损耗，这个损耗的差额就称为火耗。当然，羊毛出在羊身上，这笔火耗作为赋税的附加税，还得从老百姓那儿剥削而来。猫腻就在这里，征税时加征的火耗大于在熔铸过程产生的实际火耗，万历时期征收的火耗高达百分之二、三十，而清朝有时更是超过百分之五十。这一块利润差额就发放给地方官员作为福利。
接到钱珏的揭发之后，康熙马上召开大学士、九卿会议，询问穆尔赛居官如何？但是户部尚书科尔坤、左都御史陈廷敬等群臣都说他为人朴实、不生事。这岂不是官官相护吗？康熙心中狐疑，就让御史钱珏亲自去调查。结果发现穆尔赛不但多加了文水等县的火耗，而且在女儿出嫁无耻地向下属索取贿赂。更有甚者，已经被革职的通判张谦，勾结穆尔赛的家人，打着穆尔赛的招牌，四处招摇撞骗，诈取官员的钱财。
康熙二话没说，立即下令将穆尔赛捉拿到北京城，审讯之后，钱珏的检举均属实。这下子康熙火了，痛斥科尔坤和陈廷敬等人，不是说穆尔赛为人朴实、不生事吗？康熙因而训斥群臣，“朕不行立断，谁肯执法耶？治天下以惩贪奖廉为要，廉洁者奖一以劝众，贪婪者惩一以儆百。”当即诏令将穆尔赛处以极刑，以杀鸡儆猴。
为了疏通言路，发动全民反腐，让贪腐分子成为过街老鼠，无所遁形，康熙还鼓励打小报告，祭出风闻言事的招法。风闻言事，意即只要捕捉到未经证实的八卦消息，就可以向朝廷举报。明朝曾经一度盛行，因为风闻言事极易造成官员之间的相互攻讦，影响团结，所以在顺治和康熙初期都禁止。但是穆尔赛贪污案暴露出朝廷内外腐败成风，相互包庇。在这危机关头，康熙下定决心重开风闻言事。公元1687年，康熙告谕大学士，“凡参劾贪官、其受贿作弊之处、因未曾亲睹、无所凭据、畏缩而不行参劾者甚多。今间有弹章，亦止据风闻参劾耳。岂有身与之通同受贿作弊，而顾肯参劾之耶？向者原有风闻纠弹之例。辅政大臣停止。今再行此例，贪官似有儆惧。若有挟讎参劾者，审明果系挟讎，自有反坐之典在。”
风闻纠劾重启之后，言路大开，反腐机构——都察院成了当时最忙碌的官署，御史们整天忙着搜集材料，打听花边新闻，结果一个个巨贪大腐纷纷落马。其中最为震撼的是公元1688年有“铁面御史”之称的郭琇扳倒了权臣、大学士明珠党案。
郭琇是山东即墨人，曾经也是个臭名昭著的贪官污吏。公元1670年郭琇进士中举，九年之后出任吴江县令。刚上任时，郭琇的顶头上司江宁巡抚余国柱是大贪官，四处搜刮民财。上梁不正下梁歪，余国柱贪，郭琇比他更贪，闹得天怒人怨。不久，余国柱调走了。新来的江宁巡抚汤斌是个如假包换的大清官，他上任之后烧的第一把火就是向全省通报郭琇的贪腐行为。郭琇跑去见他，我之所以贪酷，是因为前任余国柱贪婪。我不跟着贪婪，就没法混下去了。请给我一个月时间，让我洗心革面。如果到时再听到我的坏名声，任你处置好了。
汤斌就给了郭琇一次机会，姑且听其言、察其行吧。郭琇回到吴江之后，马上进行大扫除，将办公署衙洗得一尘不染。他告诉众人，“前令郭琇已死，今来者又一郭琇也。”——过去的郭琇已经死了，今天又来了一个新的郭琇。从此郭琇走上清廉之道，名声日益卓著。
汤斌很高兴，这家伙是浪子回头金不换啊！立刻向康熙推荐。于是在公元1686年，郭琇被提拔为江南道御史。任职期间，郭琇弹劾河道总督靳辅治理黄河无功，结果靳辅被罢官。郭琇由此捞到了政治资本，两年后升任左佥都御史（相当于中纪委副书记的助手）。
在处理靳辅案时，康熙曾经问郭琇一句话，“廷臣中有掣肘河务者，尔于本内曾言及否？”——朝廷上有重臣插手治黄的事，你在奏疏中提到没有？
郭琇当即领会到康熙话中有话，在他上任的第二天，就做出惊天之举，上了一道《特纠大臣疏》，弹劾权臣、大学士纳兰明珠，连曾经的老上级余国柱等人也告了一把。这个余国柱一年前升为武英殿大学士，攀附明珠，一切唯他马首是瞻，被人讽之为“余秦桧”。在《特纠大臣疏》中，郭琇罗列明珠和余国柱的罪状有：
（一）专断独行，投机取巧，贪污受贿。内阁里凡有票拟什么的，全是明珠一人说了算，余国柱只是唯唯诺诺的跟屁虫而已。明珠帮人呈送奏疏，如果皇帝赞扬，明珠邀功是他推荐的。如果皇帝不满意，明珠就说多亏了他和稀泥。八面玲珑，骗取官僚们的信任，有时还趁机索贿。所任用河道总督靳辅治理黄河，耗费银两无数，大都被他们三人私分。而靳辅有明珠、余国柱当靠山，敢于为非作歹，甚至违逆皇命。(www.xing528.com)
（二）结党营私，卖官鬻爵，钳制言论。明珠的党羽，满人有尚书佛伦、葛思泰及其族侄侍郎傅腊塔、席珠等，汉人则有余国柱、李之芳、熊一潇等。尤其是余国柱，简直就是囊橐（混蛋草包）。地方总督、巡抚、布政司、按察使、学政使，职位一旦空缺，都被余国柱按职论价，兜售牟利。由此造成地方督抚贪残刻薄，任意盘剥百姓。明珠、余国柱还插手六科、都察院的事，钳制言论。谁要想进六科、都察院，明珠、余国柱都跟他们约定，日后若有奏疏先要经过他们过目等等。
平心而论，明珠的专权腐败都是康熙一手造成的。为避免皇室贵勋索额图一股独大，康熙坐视甚至纵容明珠势力的不断增长，借以牵制索额图。但是明珠又毫无节制地独揽朝政、贪财纳贿，渐成尾大不掉之势。康熙再也看不下去了，所以郭琇的《特纠大臣疏》一呈上来，康熙果断做出决定，将五位当朝大学士撤换了四位，明珠、余国柱、勒德洪勒令革职，李之芳罢官回籍。并惩处了涉案的大批高官，吏部尚书科尔坤、户部尚书佛伦、工部尚书熊一潇亦等被解职。
明珠案发不久，御史陈紫芝又弹劾明珠的党羽、湖北巡抚张汧在任上贪污九万两白银。康熙派遣户部湖广侍郎色楞额前往勘讯，案情越来越复杂，案中案接连不断，包括康熙身边的亲信或名臣诸如高士奇、徐乾学、陈廷敬等人都被卷进去，引发官场的大地震。
色楞额查案回来报告康熙说，张汧揭发了荆南道参议祖泽深、枝江知县赵嘉星等人贪污。试图以此来转移视线，为张汧开脱。因为张汧此人非同小可，不但是明珠的心腹，更是康熙身边大红人陈廷敬的亲家。听取了色楞额的汇报，康熙很不满意，认为色楞额有包庇罪犯的嫌疑。于是派遣一个特别侦察组南下调查，其成员包括有“天下第一廉吏”之称的直隶巡抚于成龙、山西巡抚马齐、都察院左副都御史开音布等三人。
于成龙三人很快就查出，张汧之前担任福建布政使时贪污无数，挥霍一空。为此勒索下属官员胡戴仁等、向盐商摊派，勉强凑合了九万两，用以抵还在福建任上的亏空。而祖泽深则是向百姓李二杨等人勒索白银八百两。康熙气得差点儿晕过去，下令严惩涉案官员：
户部侍郎色楞额查处不实，斩首。
张汧、祖泽深索贿受贿，绞死。
湖广总督徐国相包庇罪犯，革职。
布政使胡戴仁、按察使丁炜，降二级调用。
大学士梁清标、尚书熊一潇、户部侍郎王遵训、内阁学士卢琦、大理寺丞任辰旦等人因举荐担保张汧，全部被革职。
贪污漩涡案到此并没有结束，两年之后，公元1690年，已卸任的安溪知县孙镛告发福建巡抚张仲举、布政使张永茂，侵吞库帑，再次引发福建官场的大地震，有六名知府被抓，数十名州、县官员受到牵连。
康熙登时惊呆了，让于成龙的继任者直隶巡抚郭世隆到福建去调查。窟窿越捅越大，挖出了张仲举与前任福建布政使张汧合谋篡改赋税档案，侵吞了大量税银，将其捏造成百姓拖欠未上缴的罪行。
大贪官张汧调迁湖广巡抚时因挪用官物，肆意挥霍，造成福建库帑亏空三十余万两白银。而张仲举之前在湖南布政使任上也贪污了赃物无数。两人盯着黑洞洞的窟窿，心中一阵发毛。那可是杀头的大罪啊！就相互约定，赶紧设法堵掉窟窿。张汧调任湖北巡抚后，靠勒索下属和盐商，总算筹足了九万两，但是离三十余万还差远哩。随着张汧事泄被杀，张仲举越发慌了神，加紧搜刮民财，以弥补福建库帑的亏空。但为时已晚，龌龊事全被曝光了。张仲举、张永茂步张汧之后尘，被处以极刑。
从靳辅开始，到明珠，再到张汧，最后到张仲举，案中有案，扑朔迷离，终于水落石出，真相大白。这一连环案的破解，举国振奋，朝政风气为之一新，御史郭琇、陈紫芝等反腐斗士也名噪一时。在此后三、四十年间，康熙继续毫不留情地痛击贪腐分子，先后查处大批贪污要案。
公元1688年，陕西按察使索尔逊贪污受贿一百六十两白银，按照《大清律》，被处以绞刑。公元1691年，有人举报吏部主事朱敦厚在任山东潍县知县时，擅自私派贪污赃银四万余两，案结后朱敦厚被处以绞刑。任刑部尚书徐乾学、山东巡抚钱珏受到牵连被革职。公元1695年，康熙大赦天下，但是重申“除贪官污吏、行间犯罪，与十恶等死罪外”，将贪官污吏排在大赦黑名单的第一位。公元1698年，山东发生饥荒，巡抚李炜身为父母官，不知抚恤百姓，犯下严重渎职罪，被康熙罢官。
康熙晚年吏治有所松弛，官吏腐败有加剧的倾向，贪贿赃款数字越来越大，导致国库亏空严重，出现了“日不暇给”的尴尬情况。公元1710年，四川布政使卞永式征收钱粮时非法加派，用以贿赂巡抚能泰，结果能泰被处以绞刑。公元1715年，户部尚书赵申乔的儿子山西太原府知府赵凤诏贪污受贿三十万两，被处死。公元1710年的户部尚书希福纳贪污案涉及人数高达一百一十二人，赃款累计六十四万两。如此特大级贪污案令人怵目惊心，但是康熙却做了宽大的处理，“朕反复思之，终夜不寐，若将伊等审问，获罪之人甚多矣。”——由于担心牵涉面太广，影响朝廷声誉，康熙只革去希福纳的职务，其余的涉案官员在吐出赃款后都予无罪释放。
康熙在位六十一年，朝廷一、二品高官犯罪案件九桩，而顺治在位十八年间就有六桩，可见康熙的反腐举措效果确实不错，对澄清吏治发挥了极大的作用。
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