朱熹是南宋的理学家，他继承了二程的思想，集理学之大成，人们常以“程朱理学”相称。朱熹对易学有很深的研究，著作也很多。但他不同意程颐对《河图》《洛书》的看法。在他的著作《周易本义》以及《易学启蒙》中对《河图》《洛书》都作了肯定，承认伏羲以《河图》《洛书》画八卦的做法。
图八 朱子图说
朱熹对《河图》《洛书》作了很高的评价，朱熹在《易学启蒙序》中肯定了圣人画卦设爻的功劳。他说：“圣人观象以画八卦，揲蓍以命爻，使天下后世之人，皆有决嫌疑，定犹豫，而不迷于吉凶悔吝之途。其功可谓盛矣。”（朱熹：《周易本义》附录，第205 页）这就肯定了伏羲是据《河图》《洛书》画八卦，有以揲蓍命爻，帮助人们趋利避害、趋吉避凶的功劳是不可磨灭的。在这篇序文中，他还批评了象数学派和义理学派的片面性，强调义理和象数都不可偏废。
朱熹在《易学启蒙序》中，首先对《河图》《洛书》的流变作了说明，自《易传》提出河出图、洛出书以后，西汉的孔安国，刘向、刘歆父子，班固以及北魏的关子明，北宋的邵雍等都承认伏羲据《河图》以画八卦，大禹据龟背之九纹而作九鼎（载九履一，左三右七，以二四为肩，六八为足，正指龟之象也）。关子明和邵雍都以十为《河图》，以九为《洛书》。而刘牧则以九为《河图》，十为《洛书》，并指出这种说法出于陈抟。他认为《河图》之数45，没中间五阳之数，说《河图》陈四象而不立五行，《洛书》之数45，《洛书》演五行而不述四象。与诸儒之说法不同。
朱熹认为《河图》和《洛书》、八卦和九鼎可以互为表里。伏羲据《河图》以画八卦，不必预见《洛书》，但逆于《洛书》合。大禹据《洛书》以作九鼎，也不必追求《河图》，但暗与《河图》合。所以如此，皆因理而合，圣人据《河图》《洛书》作易作范，皆出于天意。而卜筮与蓍龟，不能只依卜和龟为标准，言其理一而无二。
朱熹考察《河图》《洛书》的流变之后，对《河图》作了解释。据《易·系辞上》曰：“天一地二，天三地四，天五地六，天七地八，天九地十。”“天数五，地数五，五位相得而各有合。天数二十有五，地数三十，凡天地之数五十有五。此所以成变化而行鬼神也。”朱熹说：“此一节，夫子所以发明河图之数也。天地之间，一气而已，分而为二，则为阴阳，而五行造化，万物始终，无不管于是焉。故河图之位，一与六共宗而居乎北，二与七为朋而居乎南，三与八同道而居乎东，四与九为友而居乎西，五与十相守而居乎中。”（朱熹：《周易本义》附录，第208—209 页）在《河图》之中，天数一、三、五、七、九之和是二十五，地数二、四、六、八、十之和是三十。天地之数相加是五十五。
在《河图》中，还有与五行的关系：天一生水，地以六成之；地二生火，天以七成之。天三生木，地以八成之；地四生金，天以九成之；天五生土，地以十成之。“天数地数各以类相求，所谓五行之位相得者然也。”
朱熹作《先天图》诗二首（《朱熹集·外集》卷1《诗书》）：
不待安排自整齐，
只缘太极本如斯。(www.xing528.com)
试将万事依图看，
先后乘除可理推。
——《先天图》
乾坤复姤互推移，
动静之端起至微。
终日敛襟看不足，
其中图处是真机。
——《先天图二》
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