俄国使节叶夫菲米·瓦西里耶维奇·普佳京要求日本勘定边界，这让德川幕府深感加强北疆的防守的重要性。安政元年正月，筒井政宪、川路圣谟上书幕府：
我等建议幕府派人到萨哈林岛进行勘测，调查可作为边界之地。否则，再过一年，萨哈林岛就不属于日本所有了。(www.xing528.com)
安政元年二月八日，德川幕府派村垣范正等考察松前和虾夷地区。通过这一措施，德川幕府对萨哈林岛的风土人情更加清楚了。德川幕府意识到要想保住萨哈林岛，就必须巩固对北海道的统治，加强北海道地区的防守。北海道地域广阔，大部分居民是夷人，靠打鱼为生，仅设松前藩进行管理是不够的。在宽政文化年间，德川幕府曾将松前藩收为直辖领地。在文政年间，德川幕府又将松前还给了松前氏，松前氏却无法管理好这里。嘉永六年（1853年），叶夫菲米·瓦西里耶维奇·普佳京来日本长崎后，以德川齐昭为首的一派建议德川幕府收回松前。于是，德川幕府将松前收回，定为直辖领地，设立了箱馆奉行来管理这一地区。安政二年（1855年）二月，德川幕府从松前氏那里收回了虾夷地区，也归箱馆奉行管辖。箱馆奉行总共有三人，一人常驻江户，其余两人常驻箱馆，并且这两人轮流巡视萨哈林岛和边境地区。弘前藩、盛冈藩、仙台藩和秋田藩负责出兵守卫箱馆、松前及虾夷地区。安政二年十月，德川幕府下令各藩国的藩士、俸禄在五百石以下的幕士的二儿子和三儿子、浪人、农民、工商阶层移居箱馆、松前、虾夷地区，从事开荒、采矿、伐木烧炭、打猎、打鱼等工作。此外，在箱馆奉行的建议下，德川幕府开始加固箱馆、虾夷地区的旧炮台，加强大炮和炮弹的配备，还在各处新建炮台。然而，德川幕府财政拮据，这些措施虎头蛇尾，根本无法抵御外敌的入侵。
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