在公元前445年之后十四年的和平期内，伯里克利的统治仅仅遭受过一次重要战役的干扰。这场战争始于萨摩斯岛的叛离。萨摩斯岛是提洛同盟中三个保留海军的城邦之一，而萨摩斯岛保留海军是为了不至于像它的邻邦一样完全沦为雅典的附属。萨摩斯岛和米利都存在领土争议。在该争议提请雅典裁决后，雅典人将土地划给了米利都。然而，萨摩斯岛的寡头不愿放弃领地，并一直坚持不懈。接着，雅典派出一支四十艘船组成的舰队进入萨摩斯岛港口。舰队指挥官是伯里克利。他迅速镇压当地寡头政府，在萨摩斯岛建立民主政体。接着，伯里克利带走一百名人质，将他们遣送到雅典的军事殖民地利姆诺斯岛。雅典的高压政策激起了萨摩斯岛人的民族仇恨。萨摩斯岛残余的寡头成员引来吕底亚总督皮苏特尼斯的支援，推翻了新建的民主政体，并宣布退出提洛同盟。接着，萨摩斯岛匆匆派出几艘船驶往利姆诺斯岛，解救困在利姆诺斯岛的人质，并由此与雅典开战。纳克索斯岛和萨索斯的前车之鉴并没有让萨摩斯岛人望而却步。他们自信可以夺回完全的自治权，并呼吁其他提洛同盟的成员加入他们的阵营，反抗雅典。然而，在所有提洛同盟成员中，只有拜占庭无畏地宣告自己脱离提洛同盟，直面雅典的暴怒。
萨摩斯岛人起义的消息一传到雅典，雅典就派出一支远征军攻打萨摩斯岛。远征舰队由六十艘船组成，共有十位指挥官。其中，伯里克利为总指挥。诗人索福克勒斯也是指挥官之一。雅典远征军穿过爱琴海，在特雷吉亚岛附近与萨摩斯岛舰队交锋，并打败了他们。不久后，伯里克利从雅典、希俄斯岛和莱斯博斯岛补充兵力，集结了一百二十五艘船，将萨摩斯岛从海陆两处团团封锁。然而，有消息称吕底亚总督皮苏特尼斯已经派出腓尼基舰队。这个谣言诱使伯里克利分派出一半兵力前往吕西亚海岸，以监视腓尼基舰队的靠近。萨摩斯岛人抓住时机，大胆地从港口派出七十艘船，与前来封锁的雅典海军部队交锋，并彻底打败这支雅典海军部队。十四天来，萨摩斯岛人都掌握着海上控制权，因而能够派出信使祈求多方援助，尤其是斯巴达人的支援。然而，不久后，雅典的增援兵力就从四面八方赶来。萨摩斯岛再次被封锁。萨摩斯岛人展开了殊死搏斗。虽然当时最负盛名的技师亚提蒙为伯里克利建造了许多新型的攻城器械，但萨摩斯岛人还是在防御中大获全胜。九个月过去后，萨摩斯岛人终于确信没有人前来支援自己，被迫投降。与纳克索斯岛和萨索斯一样，萨摩斯岛人不仅被迫拆毁城墙，交出战船，还要交纳一千塔连特的赔款。奇怪的是，雅典人不再强迫萨摩斯岛成立民主政府，而是保留了寡头政体。惩戒萨摩斯岛的消息一出来，拜占庭立刻宣布投降。
萨摩斯岛人向斯巴达发出的求救信息几乎引发了欧罗巴希腊的全面战争。监察官们召集盟友举行大会。不少城邦都认为攻打雅典的时机已到。然而，科林斯说服了斯巴达政府要保持克制。据说当时，斯巴达的附属同盟也在蠢蠢欲动，而毫无疑问，支援萨摩斯岛是对附属成员叛离宗主国行为的鼓励。希腊境内再次爆发战争并不是萨摩斯岛造成的，而是一系列其他积怨作用的结果。
[1]古希腊银币。(www.xing528.com)
[2]意为“战斗在前线的雅典娜”。
[3]出自希腊神话。
[4]相当于九千七百五十磅。——原注
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