吕底亚覆灭后，伊奥尼亚和伊奥里斯的希腊人开始与居鲁士二世直接接触。米利都人曾经归顺居鲁士二世，享受着与克罗伊斯统治时期类似的半独立状态。其他沿海城邦则全力抵抗居鲁士二世，力争夺回自己的自由。虽然斯巴达人拒绝援助，但这些沿海城邦还是得到了好战的卡里亚人和吕西亚人的支持。而在帕克提亚斯，还有一位吕底亚首领试图呼吁刚刚被征服的同胞们起身反抗。居鲁士二世不满足于仅仅征服几个反叛的城镇，决心实现宏图大业。他亲自率兵攻打巴比伦。居鲁士二世留下一支军队交由一位叫玛扎列斯的米底人贵族统领，让他完成对小亚细亚的征服。玛扎列斯平定了吕底亚的反抗，接着攻打伊奥尼亚人，攻占并洗劫了普里恩，并将整片迈安德平原夷为平地。然而，在紧要关头，玛扎列斯突然离世。军队由一位叫“哈尔帕哥斯”的米底人接替掌管。在罢黜阿斯提阿格斯时，哈尔帕哥斯功勋卓著，深受居鲁士二世信任。哈尔帕哥斯包围了福西亚和特奥斯。福西亚和特奥斯的居民绝望之余，从海路逃亡，前往遥远的海岸，远离居鲁士二世的势力范围。特奥斯人来到了色雷斯的阿布德拉。不久，阿布德拉就成为爱琴海北岸最大的城市。福西亚人一路航行到遥远的西方，在科西嘉岛的一处港口阿拉利亚登陆，并试图与岛上居民展开贸易往来——与两百年前他们的伊奥尼亚近亲和西西里岛打交道的方式如出一辙。然而，阿拉利亚对科西嘉岛的意义远不如纳克索斯岛对西西里岛的意义。在与迦太基和伊特鲁利亚联合海军徒劳地对抗五年后，福西亚人只得放弃阿拉利亚。其中一些福西亚人向北航行，加入了马西利亚古老的福西亚人殖民地。马西利亚地处高卢。随着该次迁徙，高卢人口激增，日渐重要起来。在波塞冬尼亚以南的卢卡利亚沿岸，其他福西亚人建立了一个新的城镇，取名“叙埃雷”，即韦利亚。
叙埃雷出土的货币
亚细亚其他希腊城市并没有表现出这样孤注一掷千方百计摆脱波斯枷锁的决心。历经一系列糟糕至极的联合对抗后，他们向哈尔帕哥斯打开城门。岛上居民的反抗和大陆居民的反抗一样徒劳，莱斯博斯岛、希俄斯岛、以弗所和士麦那都承认居鲁士二世是他们的宗主。只有萨摩斯岛在僭主波利克拉特斯的统治下保持独立。波利克拉特斯拥有爱琴海东岸最强大的海军。居鲁士二世还没有舰队，波利克拉特斯因而希望能保留自己的岛屿及制海权不受侵扰。对希腊来说，萨摩斯岛的独立并不是一桩好事。萨摩斯岛的海盗船让整片爱琴海东岸敬畏不已，成为继米利都之后的海上霸主。波利克拉特斯以掠夺抢劫为生，并因此兴盛起来。波利克拉特斯总是宣称他制定了一项规则，即不加区分地抢劫所有人，因为他发现，与原封不动地保存财物相比，自己的友人们在重获被偷走的财富时会更加心存感激。(www.xing528.com)
哈尔帕哥斯对亚细亚希腊人采取的政策并不苛刻。希腊人须每年缴纳贡品，并在君主下令时提供武装军队。希腊诸城市的内部政府都维持原状。由僭主统治的城邦继续由原僭主统治；民主制的城邦依然维持民主制；而寡头统治的城邦与完全自治自主时别无二致。
波利克拉特斯
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