1.基本检索
(1)通过作者检索:在检索框中输入作者的姓氏和不带标点符号的首字母,然后单击“search”。如果只知道作者的姓氏,输入作者检索字段标签[au],如brody[au],如图4-11-2所示。使用姓+首字母格式(例如,smith ja)或全名格式(john a smith)输入的姓名,如果它们存在于PubMed中,则没有检索标记的姓名将作为作者或合作者进行检索。以自然或倒序输入完整的作者姓名,例如:julia s wong或wong julia s。在2002年之前,PubMed的引文中不包括完整的作者姓名,因此完整的作者姓名检索只能检索2002年以后的引文,也就是全文发表在文章中的时候。用于检索的姓氏后面的逗号是可选的。然而,对于一些名字,有必要通过在姓后面加逗号来区分哪个是姓,例如,james,ryan。省略首字母后的句点,将所有后缀放在末尾,例如vollmer charles jr。
关于作者检索的更多信息:
① 要使用检索生成器按作者检索,单击“Advanced search”,然后从所有字段菜单中选择作者。
② 你可以单击摘要显示上的作者链接,在PubMed中执行对作者的检索。如果作者的名字在计算上与其他已发表文献的引用相似,则结果将使用排名算法显示。
③ 作者的名字会被自动截断,以考虑到不同的首字母和名称,比如Jr。为了避免截断,可以在作者的名字周围使用双引号,作者检索字段标签为[au],例如“smith j”[au]。
④ 使用检索字段标签[1au]来检索文章的第一个作者,使用[lastau]来检索引文中最后一个作者的名字。
图4-11-2 通过作者检索
(2)通过期刊检索:在检索框中输入期刊全称(比如,molecular biology of the cell)、名称缩写(比如,mol biol cell)、际标准化编码ISSN(如1059~1524)均可进行期刊检索,如图4-11-3所示。
图4-11-3 通过期刊检索
关于期刊的更多信息:
① 要使用检索生成器进行期刊检索,单击高级检索,然后从所有字段菜单中选择期刊journal。
② 要查找完整的期刊名称,请使用NLM目录,或鼠标滑过引文上的期刊标题缩写(可在摘要视图中找到)。点击PubMed主页上的“journal”,如图4-11-4所示。输入期刊名称并单击“Search”。
图4-11-4 查找完整的期刊名称
③ 使用期刊检索字段标签[ta]将你的检索限制在期刊上,例如,gene therapy[ta],scanning[ta]
④ 对于索引项的完整检索,建议使用完整的期刊题目或缩写检索;较老的引文可能没有ISSN码。
⑤ 如果期刊标题或缩写包含特殊字符(如圆括号、方括号和),请输入不含特殊字符的标题或缩写。
⑥ 检索期刊将自动映射到官方期刊标题和与替代标题相关的标题(如果存在的话)。要关闭这种自动映射,请输入双引号和标记为[ta]的期刊,例如“science”[ta]。
(3)通过日期检索:使用结果时间轴。按年时间轴单击并拖动结果上的滑块,可以更改检索的日期范围,如图4-11-5所示。注意:以年份为时间轴的结果统计了由出版商提供的引文的所有出版日期,例如印刷和电子出版日期。这些日期可以跨越一年以上:例如,2018年11月在网上发表的一篇文章和2019年1月在印刷版上发表的一篇文章。这意味着时间轴中表示的结果总和可能与检索结果计数不同。
图4-11-5 通过日期检索
2.高级检索
高级检索(见图4-11-6)的步骤如下:① 点击高级检索并使用检索生成器;② 从“All Fields”菜单中选择某几个或一个字段并输入检索词。例如选择一个日期字段“Date-Publication”,然后在检索框中输入单个日期或日期范围,日期和月份是可选的,如果要检索到当前日期为止的日期范围,请不要编辑“当前”日期框;③ 点击检索。高级检索界面下可进行多种检索条件的限定。同时可显示检索历史,允许使用检索史序号进行组配检索。PubMed可选择的字段多达30多个。
图4-11-6 高级检索
3.检索结果的优化
用户可以通过过滤器来缩小检索结果的范围,可以优化的字段包括文章类型、拥有全文、出版日期、物种、语言、性别、主题、期刊类型和年龄,如图4-11-7所示。
图4-11-7 优化检索结果
使用过滤器步骤:
① 在PubMed上进行一次检索;
② 单击侧边栏,激活过滤器。在激活的过滤器旁边会出现一个复选标记;
③ 随后的检索将被过滤,直到所选过滤器被关闭,或者直到浏览器数据被清除。
如果用户想要在侧边栏显示额外的过滤器(见图4-11-8),请执行如下操作:
图4-11-8 添加额外的过滤器
① 点击“Additional filters”按钮。
② 弹出式菜单将显示每个类别可用的过滤器:文章类型、物种、语言、性别、主题、期刊和年龄。
③ 从菜单左侧的选项列表中选择一个类别:文章类型、物种等。
④ 在每个类别中,选择你想要添加到侧边栏中的过滤器。
⑤ 单击“Apply”。关闭弹出菜单,并在侧边栏上与其他过滤器一起显示你选择的额外过滤器,如图4-11-9所示。
图4-11-9 选择要添加的过滤器
⑥ 如果想要取消选择的过滤器,请单击“cancel”或单击右上角的“X”以关闭弹出窗口并返回检索结果。
⑦ 要将过滤器应用到检索中,请单击侧边栏上的筛选器。(www.xing528.com)
4.检索高级技巧
(1)年龄过滤器:年龄过滤器将人类研究的结果限制在特定的年龄组。你可以使用附加过滤器按钮向侧边栏添加年龄过滤器。
年龄过滤器包括:
Child:出生~18岁
Newborn:出生~1个月
Infant:出生~23个月
Infant:1~23个月
Preschool Child:2~5岁
Child:6~12 岁
Adolescent:13~18岁
Adult:19+岁
Young Adult:19~24岁
Adult:19~44岁
Middle Aged + Aged:45+岁
Middle Aged:45~64岁
Aged:65+岁
80 and over:80+岁
这些过滤器可能会排除一些引用,因为他们还没有完成MEDLINE索引过程。
(2)检索一个短语。但PubMed不执行邻接检索。许多短语被PubMed自动术语映射(ATM)中使用的主题翻译表识别。例如,如果你输入“fever of unknown origin”,PubMed将这个短语识别为一个MeSH术语。你可以使用以下格式绕过ATM并检索一个特定的短语:
① 用双引号括起"kidney allograft"。如果你使用了引号,而短语在短语索引中没有找到,则忽略引号,并使用自动术语映射处理术语。
② 使用检索标签:kidney allograft[tw]。如果你使用检索标签而短语在短语索引中没有找到,则短语将被分解为单独的术语,例如“psittacine flight”不在短语索引中,因此对psittacine flight[tw]的检索将被分解为:((("psittaciformes"[MeSH Terms]OR "psittaciformes"[All Fields])OR "psittacine"[All Fields])OR "psittacines"[All Fields])AND "flight"[Text Word]。
③ 使用连字符:kidney-allograft。如果使用连字符,而短语在短语索引中没有找到,检索将不会返回该短语的任何结果。短语可以出现在PubMed记录中,但不能出现在短语索引中。要浏览索引的短语,使用高级检索生成器中包含的显示索引特性:选择一个检索字段,输入短语的开头,然后单击显示索引。当你以短语的形式输入检索词时,PubMed将不会执行自动的术语映射,其中包括MeSH术语以及在该术语下缩进的任何特定术语。例如,“health planning”将包括索引到MeSH术语Health Planning的引用,但不包括在自动网格映射中包含的更具体的术语,例如Health Care Rationing,Health Care Reform,Health Plan Implementation。
(3)截断检索条目。要检索所有以单词开头的术语,请输入单词后跟星号(*):通配符。要检索一个包含截断术语的短语,使用以下格式:
用双引号括起短语:"breast feed*"
使用检索标签:breast feed*[tiab]
使用连字符:breast-feed*
在被截断的术语中必须至少提供四个字符。被截断的术语必须是短语中的最后一个单词。截断终止于一个词的末尾;它不处理空格以外的内容。截断关闭自动术语映射和过程,包括MeSH术语和在MeSH层次结构下缩进的任何特定术语。比如,heart attack*将不会映射到MeSH术语Myocardial Infarction或者包括任何特定的术语,比如Myocardial Stunning;Shock,Cardiogenic。
(4)将检索条目与布尔运算符(AND,OR,NOT)组合在一起。PubMed在检索内容之间默认使用AND运算符,比如"vitamin c common cold"被翻译为vitamin c AND common cold。输入大写的布尔运算符来组合或排除检索项:AND 检索包含所有检索词的结果;OR 检索包含至少一个检索词的结果;NOT从你的检索中排除检索术语。
PubMed按照从左到右的顺序进行检索。使用括号来“嵌套”应该作为一个单元处理的内容,然后合并到整个检索中。PubMed使用自动术语映射来确定内容。比如,检索air bladder fistula,PubMed将会把air bladder作为一个短语进行检索。如果你不想要这种自动短语解析,使用布尔运算符AND,比如air AND bladder AND fistula。
(5)在线收藏。
用户对感兴趣的检索结果可以点击右侧的五角星,对该篇文章进行收藏(见图4-11-10),但需要提前注册账号,如图4-11-10所示。
图4-11-10 选择要添加的过滤器
(6)订阅提醒。
创建PubMed提醒(电子邮件)。系统会自动通过电子邮件向用户发送一组预定义的搜索字词的结果,且每封电子邮件都会包含一批新的论文,如图4-11-11所示。操作步骤如下。
第1步:注册NCBI账号。在PubMed主页,单击“登录”,然后选择“注册”。填写所有详细信息,然后单击“注册”。
第2步:执行搜索。确保已经登录(用户名应显示在PubMed主页的右上角)。注意:最好使用高级检索或组合检索,检索词尽量精准,否则PubMed的后续更新提醒效果会大打折扣。
第3步:保存搜索结果。执行完搜索后,可得到以下界面。
图4-11-11 选择要添加的过滤器
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