毛目中所載書籍次序基本依照《經籍考》，書名下附有小字注，則多列舉著者姓名，至於著者朝代，或載或闕，字號、籍貫亦如此，著者不詳則標“不著名”或空闕，若爲一卷本，或省卷數，或列出“一卷”，并無常制。偶有簡略幾字叙述書籍内容。這些注文文字均與《經籍考》輯録内容信息一致，只有文字多寡之别。以上文所舉“目録”類書籍爲例，如：
《大宋史館書目》一卷 晁氏曰：皇朝史館書，總計一萬五千一百四十二卷。（《經籍考》卷三十四[21]）
《大宋史館書目》一卷 計一萬五千一百四十二卷（《汲古閣毛氏藏書目録》）(www.xing528.com)
毛目小字内容似從《經籍考》簡略抄撰而成。又毛本第45“類書”類載“《錦綉萬花谷》四十卷續四十卷”，小字注：“陳氏序稱淳熙五年作而不著名。”全書僅此處獨載“陳氏序稱”字樣，而《經籍考》此目下小字注正作：“陳氏序稱淳熙十五年而不著名氏，門類無倫理，序文亦拙。”毛目蓋據此段文字而删削抄録。又上文所舉的《群書備檢》，《經籍考》與毛目均作十卷，而《直齋書齋解題》作三卷；《群書會記》三十六卷及《崇文總目》六十四卷，《經籍考》與毛目載卷數均同，《直齋書録解題》分别載作二十六卷和一卷。再比如，鄧子勉載：“所載詞集，見於‘歌詞’類，共計一百三種，除《花間集》、《南唐二主詞》、《陽春録》外，其餘均爲宋人編撰，有詞别集九十三種，詞集注本二種，選集五種。‘别集’類亦附載有詞集。核以陳振孫《直齋書録解題》所載詞集，有十七種爲毛晉書目所缺，又卷數不同的有二：陽春録五卷，直齋作一卷；樂府雅詞十二卷拾遺二卷，直齋作三卷拾遺二卷。其餘諸詞集，兩書作者、書名、卷數，除個别存有訛字外，均是相同的。”[22]按，《經籍考》作《陽春録》一卷，而毛本此處“五”校改作“一”，中科院藏本及甲庫善本均作一卷，同於《直齋》，蓋鄧子勉依據毛本原“五卷”，未依其所校正“一卷”文字；《樂府雅詞》卷數，《經籍考》與毛本同，均作十二卷《拾遺》二卷，不同於《直齋》。由此可見，毛目很有可能是直接依據《經籍考》編撰而成，而非《直齋書録解題》。
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