毛目著録圖書五十二類目，分别爲：1.易；2.書；3.詩；4.禮；5.春秋；6.論語；7.孟子；8.孝經；9.經解；10.樂；11.儀注；12.讖緯；13.小學；14.正史；15.編年；16.起居注；17.傳記；18.僞霸；19.鈔；20.故事；21.職官；22.刑法；23.地理；24.時令；25.譜牒；26.目録；27.儒家；28.道家；29.法家；30.名家；31.墨家；32.縱横家；33.雜家；34.小説家；35.農家；36.天文；37.曆算；38.五行；39.占筮；40.形法；41.兵書；42.醫家；43.神仙；44.釋氏；45.類書；46.雜藝術；47.别集全；48.别集注；49.歌詞；50.章奏；51.總集；52.文史。其中第1至13爲經部共十三類，第14至26爲史部共十三類；第27至46爲子部共二十類，第47至52爲集部共六類，總體上仍依經史子集四部順序分别著録，每個子目又依著者時代先後分别列出。
通過查考，此五十二類目名稱及類目次序均與《文獻通考·經籍考》（下簡稱《經籍考》）基本一致。《經籍考》分經史子集四部，共設類目五十五類，收書五千種左右[15]，一一收録“存於近世而可考者”，即唐宋時代流通的圖書。其中，經部共十四類，比毛目中多“謚法”類。《經籍考》以前的書目，著録與謚法有關的書皆入經部“經解”類，從馬氏開始，才新增“謚法”作爲一類置於經部中，收書八種，毛目中未著録此類。此外，馬氏書中首次將“儀注”類由史部提升至經部，毛目據之承襲。史部共十四類，比毛目多“雜史”類。子部共二十類，毛目同。集部共七類，分别爲賦詩、别集、詩集、歌詞、章奏、總集及文史類，毛目中“别集全”即《經籍考》的“賦詩、别集”兩類，毛目中“别集注”即《經籍考》中的“詩集”類，因此實質上分類大致相同。(www.xing528.com)
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