敦煌学的教学工作，随着改革开放政策的实施和敦煌热的不断升温，越来越显得重要。80年代以来，不少大学已开设了敦煌学课。短期的培训班、讲座，犹如雨后春笋，此起彼伏。
1984年11月，文化部文物局成都培训中心举办敦煌讲座，樊锦诗应邀讲授了《敦煌石窟艺术》。她着重讲了敦煌壁画和彩塑的特点、历史、现状和价值，博得同志们的好评。
1986年4月至5月，她在武汉大学历史系考古专业、博物馆专业讲授了《中国石窟寺考古概况》。听讲的学生很多，教室里挤得满满的。她主要讲了石窟考古方面的基础知识，敦煌的成就以及自己的体会。后来她出题对听讲的学生进行了考试，效果还是很不错的。(www.xing528.com)
前些年，敦煌研究院想从北大的毕业生中要人去敦煌工作。樊锦诗专为此事来到了母校。校友们见她都很高兴，要求她给同学们讲讲敦煌，讲讲自己，讲讲敦煌的现在和未来。北大图书馆系团委的同学更是急不可耐，向全校发出了海报。临讲那天，北大阶梯式教室里挤满了人。她开始着实有些紧张。可是她想到讲敦煌的事，讲敦煌的人，讲敦煌的变化，讲自己的成长，讲自己了解的和做过的事，就心地坦然了。她以敦煌的人为轴心，讲了以常书鸿为代表的第一代，以段文杰为代表的第二代，还有她自己这一代共三代人。讲了他们的成长、奉献和开拓，如何同恶劣的环境、艰苦的条件做斗争，从而获得了可喜的成果。听众不时爆发出热烈的掌声。
此外，1991年4月，她为甘肃联合大学文博专业班讲授《石窟考古》，讲了30多个小时，得到同学们的好评。她还在中国科学院兰州分院、湖北省博物馆、兰州大学讲过多次。还为北京大学考古系1981、1982、1984、1985年来敦煌实习的大学生、研究生，做过多次辅导。
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