《中国大百科全书》邀樊锦诗写了两个词条，即“莫高窟”和“榆林窟”。本来早已交稿。最近，他们又寄来，让再核对一下。要核对，就得查资料。所以，她利用星期六晚上的时间，一直干到凌晨4点。
樊锦诗住一楼套房。客厅同里间，用质地厚重的杏黄色帷幕隔着。水泥地上，堆放着苹果和梨，有的已开始溃烂。沙发和茶几上放满了书。另一间，是她的写作间兼卧室，也是书的海洋。书刊资料到处都是。为了写作方便，她在床边加了块木板，是专门用它放置书刊资料的。睡觉时想起什么，翻身起来就查就写。
樊锦诗是1963年被分配到敦煌文物研究所的。在所里搞过考古工作，当过考古组长。1975年，她被提拔为副处级干部。“文革”后，继续担任敦煌文物研究所副所长。1982年被评为文博专业助理研究员。1984年12月，敦煌文物研究所升格为地级的敦煌研究院后，她被任命为副院长。1988年又晋升为副研究员。
多年来，她一直从事石窟考古工作。在研究的基础上，她自己撰写和与别人合作撰写发表了《敦煌莫高窟北朝洞窟的分期》《莫高窟隋代石窟分期》《莫高窟290窟的佛传故事画》《莫高窟北朝洞窟本生因缘故事画补考》《莫高窟北朝石窟造像和南朝影响》《敦煌壁画的保护》《丝绸古道话沧桑》《莫高窟唐前期石窟的洞窟形制及题材布局》《莫高窟发现的丝织物及其他》等多篇论文。
1989年8月，第33届国际东方学会在加拿大多伦多市召开。会前，该组织负责人之一的张火金教授三次来函邀请樊锦诗参加，并建议她讲一讲“敦煌石窟的现状与未来”。她未能参加会议，只寄去了题为《敦煌莫高窟的保存、维修及将来的计划》的论文。但由于会议收到较晚，未能宣读。该组织决定，将其收入会议的论文集。
对于她的论文，国内外都有较高的评价。比如，《古籍整理出版情况简报》和日本的《东洋学术研究》杂志，都有评论。1985年，日本东洋哲学研究所举办的“敦煌”讲座上，还把《莫高窟290窟的佛传故事画》译成日文，作为教材，进行讲授，并刊登在《东洋哲学研究》第25卷第2号上。此文还被台北《艺术家》杂志转录使用。
文物出版社黄文昆先生在《回顾敦煌文物出版工作》一文中指出：“《中国石窟·敦煌莫高窟》第一卷发表的樊锦诗、马世长、关友惠所著《敦煌莫高窟北朝洞窟的分期》，是一篇有重要学术价值的论文。它运用考古学的科学方法，第一次明确划分出莫高窟早期北凉、北魏中期、北魏晚期至西魏前期、西魏后期和北周4个不同的石窟艺术发展阶段，解开了多年来早期石窟分期中的疑团。特别是确认了一批北魏以前的石窟遗存，断代为北凉洞窟，同时又区分了北周和隋代之间的界限，推断出一批建平公时期的北周洞窟，引起了学术界的极大重视。在第二卷中，樊锦诗、关友惠、刘玉权所著《莫高窟隋代石窟分期》，将时间短、造窟频繁的隋代莫高窟分为三期，脉络分明地阐述了这个承上启下的重要变化过程，填补了隋代莫高窟研究的空白。”
日本专事石窟考古的专家长光敏雄先生，曾对樊锦诗讲：“你写的文章是科学的、可信的，希望你以后多写这样的好文章。”(www.xing528.com)
此外，她还写了不少介绍敦煌的通俗文章。为《敦煌学辞典》撰写了120条词条。
樊锦诗深有感触地说：“在石窟考古方面，我做过一些工作，写过一些文章，都是属于基础工作。不论是发掘整理，还是石窟分期都一样。在80年代前半期，由于过去的积累，写了一些文章。用考古的方法，对石窟进行断代是比较科学的。文章里每一句话的后面，都有一大堆材料。对每一个洞窟的每面墙壁、每一幅壁画，都要进行分析：分类、分型、分式。比如：
“分类：佛、菩萨、弟子；
“分型：站、坐、走；
“分式：衣着、手势、身段、发结等。
“先纵着看，后横着看。明确每幅壁画的特征，以确定每个洞窟的年代。”
1990年，敦煌研究院对专业干部进行业务考核时，考核小组对她的评价是：能够认真负责地履行岗位职责，业务水平较高，专业基础扎实，按要求完成了任务。
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