徐特立在《新学制商榷书》中指出，研究学制课程的程序是：第一，“先定教授最终之目的，如新学制所议决之六项标准是也”；第二，“目的既定，即当研究用何种教材，及教材应有如何之分量与浅深之度，方能达此目的，则课程表及教授细目当早编订也”；第三，“教材细目既定，即需统计共需多少小时，方能教完此项教材。及一年可共授若干小时，几年可以毕业可以定矣”。
谈到课程的价值取向，徐特立认为：“程度不能融通，所以应社会的需要；学年必须融通，所以应国民的经济力，又所以应天才生及低能生之个性。”具体说来，他强调制订课程有三个重要标准：“教与学都要适合当时社会的要求和受教育者个人年龄与学历情况，以及时间不浪费，思想不混乱。”他认为“国文、算术、体育、图画、唱歌等课程都有时代性”，主张课程应随着社会的发展而发展，“过去的课程标准，今天不适合的话，可以全盘否定，进行改造”，要不断使课程“发展到一个新的阶段”。
关于课程编制，徐特立认为，从小学到大学整个教学进程中，课程科目的划分犹如树木枝叶的生长：由主干而粗枝，而细枝，而群叶，而叶脉。这就是说，因为各类学校教学要求不同，所以就要由不分科到分科、到再分科。他说：“不分科的普通常识是教学的出发点。对于最初受教育的人，是要把他各方面的原始经验加以整理，使之成为科学常识，然后在这科学常识的基础上，逐渐分化为若干必修的科目和随意的科目；至于科目之最细密、最高度的分化，那就是专门学校和大学的课程了。”
根据课程科目的发展状况，徐特立提出由小学到大学五种科目的具体分类：“一、不分科的百科全书课。初级小学一年级有这种办法。曾见之于德国和法国。二、小学分为自然、社会及劳作等三个科目，曾见之于苏联小学。三、初级小学以修身、国语、算术、体操为必修科目，自然和社会包含在国语内，唱歌、图画、手工列入随意科目中，曾见之于日本小学校，四、中等学校也有并数科为一科的办法，如混合数学及博物、理化等数科的办法。五、中等以上的学校，都是以一科分为若干专科。”
徐特立指出，分科课程都是人为的，可以这样分，也可以那样分，无固定不变的分科法。但分科法也不是无规律的、绝对自由的分科法：两个极端的分科中也有中间事物做媒介。徐特立认为，科学分类，是为着专门化，以便于研究，越专门就越细分。至于开始学习的学生就不能独立地攻击一点，而是从全面的联系去了解一点。但目的不是全面的。就是说，初学者的学科，以联系学习为宜，不一定要分科。(www.xing528.com)
徐特立还把课程归纳为学科课程与术科课程两大类。他说：“学科和术科伴着发展，互相转化，互相帮助。一切生活，一切行动，不停止在当然上，而需要了解其所以然。一切知识和技术，都要通过脑的分析和集体的讨论，并经过手的试行，得到一定效果。这就是学科和术科的亲密合作，脑与手的亲密合作。”因此，徐特立反对学科课程和术科课程分离，反对只向单方面发展。他说：“只向一方面发展，造成半身不遂的、畸形发展的国民。一切畸形发展，就会失掉发展的可能性。”
徐特立认为“科目是自然的”“课程是人为的”“程度底的人要用百科全书”式课程，“多科目合为少课程，是教程度低的；分课程为许多科目，是教高程度的”。
关于课程设置与学校性质的关系，他指出：“各种不同的学校，都有他的一定教学任务，如徒工学校应以术科为主，学科应该只作术科的说明；普通学校以学科为主，术科只作学科有力的助手。至于哲理，只应该替学科服务，不是为学哲学而学哲学；只有大学校，哲理才有独立的地位。”“一个课程是百科全书，两个课程是人和物。人是社会的，物是自然的。对人和物的认识是学科，对人和物的改造是术科。”
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