按上述常规设计思想设计的引水式水电站，常常会遇到一些困难，或者说是缺点。
（1）隧洞线路增长，水头损失增大。引水式水电站的引水道常常是顺着河道，在峡谷中走的，河道两岸又常常有小支沟。如果引水隧洞高程较高，在跨越这些小支沟时，常常会使洞顶、洞侧覆盖太薄，有时甚至会露出地面，需要把隧洞改成一段明管，用桥梁的形式跨越沟谷，使工程变得复杂。如果不做桥管，就要有足够的覆盖厚度，往往要将隧洞洞线绕沟绕得远一点，也就是说会延长洞线。
从纵剖面上讲，一个较平的引水隧洞，加一个较陡的压力管道，其长度也将大于一坡到厂房的斜线。
（2）由于引水隧洞洞线高程较高，因此：①要在高程较高的地方建造调压室；②调压室到厂房机组之间要建高差较大的斜井或竖井；这些高压管道的长度相对较长，造价较高，施工困难；③如果斜井长度较长，超过200～300m，施工更加困难，往往要在中间加上一个平段，增加一个施工支洞；④为了到达施工支洞口或调压室顶部及底部，往往要修建几公里甚至十多公里长的上山公路，不但增加造价，延长工期，并且破坏环境，把峡谷中的植被破坏了；⑤上山公路坡陡弯急，十分危险，容易引发施工时的一些事故。
（3）常规设计的高压管道，往往倾向于布置在覆盖不太厚的山坡上，用钢板衬砌，到了厂房前用钢板做分岔管。这些都使工程造价增加，施工难度增加，工期增长。
（4）洞线定得高，覆盖较薄，常会遇到地质较差的问题。我国许多地方属温带、亚热带气候，气温稍高，雨水不少，风化深度比较厚，新鲜或微风化基岩埋藏深度常达20～30m，甚至40～50m。埋深浅，洞线可能在风化岩层之中，尤其是洞线与沟谷交叉处。常言道“逢沟必断”，断层埋深浅，常被定为Ⅳ类、Ⅴ类围岩，施工难度大，衬砌造价高，甚至有时不得不用钢板衬砌。如果埋深较大，深部风化程度轻一些，岩性好一点，情况可能会好一些。这些都是实际工作中常遇到的。(www.xing528.com)
（5）以往常规设计时高压管道覆盖定得浅，有的只要求埋深大于3倍开挖洞径。按现代不衬砌水道的准则来考虑，覆盖较薄时水道必须用钢筋板衬砌，分岔管也必须用钢材焊制。这样高压管道、分岔管的造价就很高了，施工工期也要长得多，甚至有时成为控制发电的关键。
（6）由于调压室在较高的位置，离厂房会较远，因此高压管道就会比较长，这样管道中水击压力就会大些，调节性能相对会较差。水击压力增大，对钢管、蜗壳、机组的要求都会提高，它们的造价也会相对较高。
（7）常规的想法倾向于做地面厂房，认为明亮、方便、安全，有益于运行人员的健康。但地下厂房也有其特殊的优点，例如适宜于在狭窄的山谷河道中修建，不会受山坡塌方、雪崩的危害，冬天、洪水季节时施工也方便，地下厂房布置有时可以比较灵活。
以上种种问题都是由于认为隧洞必须衬砌，而衬砌要承受大部分内外压力，而且要不漏水，因此要把洞线尽量定得高一点，使它尽量少承受内水压力。但是，这并不符合实际情况，在山岩条件还可以的条件下，山岩本身可以承担所有的内外荷载，渗水也不会太大，或者加以适当的处理后，可以解决承载、渗水问题。目前，很多工程已经采用了不衬砌水道，他们的设计思路完全改变了，而这种思路改变后，不仅很容易解决传统设计中遇到的一系列问题，而且可以带来一定的效益。现在人们提倡要“开拓创新，与时俱进”。笔者认为这个口号，这个要求，绝不是只对国家管理，政治思想等方面的工作有效，而是对所有的行业，各种各样的人们都适用的，因为各行各业各种人都需要进步。况且我们这种设计，已早有先例，我们只要弄清楚旁人是怎么做的，有什么规律，弄清道理，掌握要点，照此办理就可以进一大步。如果能够在此基础上再有所创新，那就更好了。
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