【摘要】:采用传统方法生产梅干菜时,制作环境相对开放,使得梅干菜中的微生物丰富且多样。本研究采用PCR-DGGE和Illumina MiSeq相结合的手段对采集自恩施地区的梅干菜样品中细菌多样性进行了解析,同时采用传统微生物学手段对其中所含乳酸菌进行了分离鉴定,以期为恩施地区梅干菜中微生物菌种资源的发掘与保护提供一定理论依据。
梅干菜又称梅菜,是以雪里蕻、芥菜或油菜为主要原料,经挑选、去根、清洗、除水、腌制和干制等传统工艺制作而成的特色发酵蔬菜[1]。采用传统方法生产梅干菜时,制作环境相对开放,使得梅干菜中的微生物丰富且多样。然而,目前对梅干菜的研究多集中于风味物质和微量元素测定[2-3]、抑菌和抗氧化能力分析[4-5]以及工艺优化[6]等方面,有关其中微生物群落结构及多样性的研究鲜见报道。
由于某些微生物的特殊生长需求及培养条件的限制,基于纯培养的传统微生物学手段只能将样品中<1%的微生物分离出来,而非培养技术的出现对于这个问题的解决提供了很好的帮助[7]。近年来,以Illumina MiSeq为代表的高通量测序技术发展迅速,为分析生境菌群多样性提供了有力手段,该技术无需对样品中微生物进行分离纯化,可直接对样本基因组脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)进行分析,能够快速、直接和真实地反映菌群物种丰度及差异[8-9]。(www.xing528.com)
本研究采用PCR-DGGE和Illumina MiSeq相结合的手段对采集自恩施地区的梅干菜样品中细菌多样性进行了解析,同时采用传统微生物学手段对其中所含乳酸菌进行了分离鉴定,以期为恩施地区梅干菜中微生物菌种资源的发掘与保护提供一定理论依据。
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