1. 仪器的依赖性
PFOS/PFOA分子中无特征官能团、沸点高，而且具有良好的表面活性，这决定了对其准确的定性分析应优先考虑使用液相色谱－质谱（LC－MS）或液相色谱－串联质谱仪（LC －MS/MS）。同时，欧盟2006/122/EC指令中，对织物或其它膜层材料中PFOS限值为1μg/m2 ，如此低的限值要求定量分析必须采用高灵敏度的LC －MS/MS。由于目前LC－MS/MS仪全部为国外生产，其售价一般在200万元以上，如此昂贵的价格使国内检测机构和企业无力购买。2009年之前，国内拥有LC－MS/MS的检测机构很少，而且主要集中于食品分析。2009年之后，因奶粉中三聚氰胺事件，LC－MS/MS在国内检测机构的普及率有所提高，部分纺织品及皮革检测实验室购买了LC－MS/MS，但至今其使用数量远远低于液相色谱及气相色谱－质谱仪，这也导致国内多数检测实验室无法开展产品中PFOS/PFOA的测试。
2. 分析用器皿的材质
含氟类的物质易于吸附在玻璃器皿上，PFOS/PFOA也不例外。一些文献和标准中对该问题进行了专门说明，而且仪器自身可能使用的含氟聚合物（如特氟龙）也会造成假阳性结果，例如GB/T 31127-2014专门指出 “LC－MS/MS管路中含有特氟龙的配件应更换为不锈钢或PEEK管”。因此在样品的预处理及仪器分析过程中，如果条件允许，应尽可能采用不锈钢或不含氟的塑料制品，确保检测结果的可靠性。(www.xing528.com)
3. 皮革萃取液的有效净化
与纺织品相比，皮革材质成分复杂。采用甲醇提取后得到的萃取液，颜色通常很深、杂质含量明显，因为样品中染料、填料及加脂剂易于进入萃取液中。PFOS和PFOA均为阴离子，而皮革中的染料、填料及加脂剂又多以阴离子材料为主，那么采用弱阴离子交换树脂（见DB33/T 749-2009）为填料的固相萃取柱对萃取样液净化处理时，杂质的去除效果并不明显，这也将会导致萃取样液中的杂质对LC－MS/MS仪器造成严重污染，该问题在实际检测过程中已经体现出，因此皮革样液有效的净化技术需要进一步研究。
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