微生物色素分为水溶性色素和脂溶性色素。色素颜色种类较多，有红、橙、黄、绿、蓝、青、紫、黑、棕等各种颜色。目前已发现可做微生物染料的有：金黄杆菌（提取黄色素）、串珠镰刀菌（提取红色镰孢菌素）、沙雷氏菌属（产生灵菌红素）、节杆菌（用于产生靛蓝）、大肠杆菌（发酵产生黑色素及合成靛蓝）、分枝杆菌（发酵合成靛蓝）、单孢菌（提取粉红色素）、蛹虫草真菌（产生橙黄色素）、紫色杆菌（产生蓝黑色的紫色杆菌素）、银杏叶内生真菌（产生山楂红色素）、紫色链霉菌（发酵产生紫色素）、黏质沙雷氏菌（产生灵菌红素）、产气弧菌（产生灵菌红素）、普城沙雷菌（产生灵菌红素）、金龟子绿僵菌（产生黄色素）、黏菌（代谢产物可分离黄色素）、红曲霉菌（合成代谢红、紫、橙和黄色素等）、蓝黑紫色杆菌（产生紫色杆菌素）、黑曲霉（曲霉属真菌，产生黑色素）、蓝色杆菌（蓝色杆菌素）、尖孢镰刀菌（产生粉紫色）、链霉菌（产生红色、黄色、橙色和紫色的染料）绿脓杆菌（产生蓝绿色绿脓菌素）、金黄葡萄球菌（发酵产生黄色素）、绿色木霉菌（产生绿色木霉黄色素）、假单孢菌（产生灵菌红素）、固氮菌（产生黑色素）、放线菌（产生黑色素）、粒毛盘菌（产生黑色素）、阿维链霉菌（产生黑色素）、南美链霉菌（产生黑色素）、交链孢霉（主要为暗黑色）、黄色短杆菌（黄色至橙色均有）、半血红丝膜菌（产生红色素）、粗毛纤孔菌（产生黑褐色至黑色色素）、掌状革菌（产生褐色色素）、彩孔菌（产生橙色，淡红褐色或淡黄褐色色素）、丝膜菌（产生浅赭色色素）、牛肝菌（产生黑色和黄色色素）、松杉暗孔菌（产生栗褐色色素）、簇生黄韧伞菇（产生黄色色素）、黑毛桩菇（产生褐色色素）、野生桑黄菌（产生黄色色素）、紫灵芝（产生紫色色素）等大型真菌。(www.xing528.com)
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