引汉济渭工程为Ⅰ等工程。秦岭隧洞主要建筑物为1级建筑物是合适的。建议本阶段细化主要建筑物组成；根据建筑物的重要性，复核3号、6号支洞及其他作为永久建筑物的支洞级别。
秦岭隧洞主洞出口主要建筑物设计洪水标准采用50年一遇，校核洪水标准采用200年一遇基本合适。建议本阶段复核支洞出口洪水标准。
根据《中国地震动参数区划图》（GB18306—2001），秦岭隧洞所在场区岭南地区地震基本烈度为6度，岭北地区地震基本烈度为7度。隧洞主要建筑物地震设防烈度可采用地震基本烈度。建议本阶段复核隧洞抗震设计标准有关内容。
（一）线路选择
根据隧洞沿线地形、地质及施工条件，本阶段在可行性研究阶段基本选定线路的基础上，结合秦岭隧洞黄三段线路选择，对秦岭隧洞越岭段线路采用左线方案和右线方案进行了进一步比较。右线方案越岭段在三河口水库大坝坝后右岸与黄三段进行连接，左线方案在左岸与黄三段进行连接。两线路地质条件差别不大。右线方案线路较短，跨河建筑物少，施工条件较优，工程投资略省，推荐右线方案是合适的。建议本阶段结合黄三段线路选择，对线路进一步复核。
本阶段对穿椒溪河局部线路比较了明洞方案和暗洞方案，暗洞方案穿椒溪河位置位于明洞方案上游1.8千米。明洞方案线路较短，但施工布置复杂，投资较高，设计推荐暗洞方案基本合适。建议完善方案比较内容。
（二）输水方式选择
根据隧洞沿线地形、地质条件和运行条件，秦岭隧洞越岭段采用无压输水方式是合适的。
（三）工程布置
秦岭隧洞越岭段工程布置基本合适。进口位于三河口水利枢纽坝后右侧，与黄三段出口相接，出口位于渭河一级支流黑河金盆水库右侧支流黄池沟，隧洞总长约81.78千米。建议复核支洞布置原则及型式。(www.xing528.com)
（四）隧洞设计
结合黄三段洞底比降选择，经方案比较选取的秦岭隧洞越岭段洞底纵比降基本合适。建议本阶段结合黄三段洞底比降选择，复核越岭段比降；补充分段比降选取内容。
隧洞断面型式选择基本合适，掘进机施工段采用圆形，钻爆法施工段采用马蹄形。建议本阶段完善钻爆法施工洞段断面型式比较内容；补充掘进机施工洞段长度选择的原则和依据；对马蹄形断面体型曲线进行比较。
隧洞断面尺寸选择基本合适。建议本阶段完善水力设计内容，复核隧洞净空；根据掘进机施工特点和围岩类别，对掘进机施工洞段开挖洞径进行复核、优化。
根据围岩分类选取的隧洞一次支护措施和二次衬砌断面型式基本合适。建议本阶段进一步研究掘进机施工段中Ⅰ、Ⅱ类围岩洞段采用锚喷衬砌型式的合理性，复核锚喷衬砌段长度；根据围岩类别，结合衬砌结构计算，复核衬砌厚度；复核、优化Ⅳ类围岩洞段一期支护参数；采用结构力学方法对衬砌结构进行计算，复核、完善结构计算成果；结合专题研究，复核结构计算中外水压力荷载和Ⅳ、Ⅴ类围岩段预留变形量；衬砌混凝土标号按现行规范执行。
隧洞灌浆和排水设计基本合适。建议复核、完善分缝设计内容。
建议补充完善隧洞进出口设计及隧洞检修、通气和放空等设计内容。
建议优化安全监测设计内容。监测设计宜以不良地质洞段为主，一般洞段监测断面和仪器布设宜简化。
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