从1951年建校至2000年，华北水利水电学院属于典型的行业办学，绝大部分时间隶属于国家水利主管部门领导。“文革”时期，水利电力部于1970年将北京水利水电学院（华北水利水电大学前身）交河北省领导，1978年更名为华北水利水电学院后再次划归水利电力部领导。20世纪90年代初迁往郑州办学后，学校确立了“立足黄河，面向三北”的服务面向。
20世纪90年代末，为了消除行业办学存在的条块分割、学科单一、规模过小、重复建设等诸多弊端，国家采取有力措施对高等学校管理体制进行重大调整，形成了“中央和省级政府两级办学，以地方统筹管理为主”的新的体制架构。在这一时代背景下，2000年，华北水利水电学院被划转河南省管理，彻底脱离了与主管部门水利部近半个世纪的行政隶属关系。
行政隶属关系发生重大改变后，华北水利水电学院根据高等教育的发展趋势和学校面临的新的办学形势，及时重新调整了学校的服务定位。(www.xing528.com)
在新的管理体制下，水利部门主管部门与水利院校的沟通机制不断弱化，对水利院校缺乏连贯性和前瞻性的政策、项目和经费支持，一些水利院校不得不追求规模化效应和综合化发展，为水利行业服务的主动性大大降低，传统的水利特色专业要么被调整，要么被撤销，削弱了水利特色学科的核心竞争力，也限制了水利高校继续为水利行业服务的能力。
为了大力推进特色鲜明的高水平教学研究型大学搭建更为广阔的平台，继续保持和发展学校的水利办学特色，华北水利水电学院积极主动地采取应对措施。2005年，学校积极向河南省人政府和国家水利部提出实现学校省部共建的战略构想和具体政策建议，得到省部领导的积极回应和高度重视。2009年，水利部陈雷部长和时任河南省省长郭庚茂在北京正式签署《共建华北水利水电学院协议》。时任华北水利水电学院党委书记朱海风高度评价了省部共建协议签署对促进学校发展的重要意义：“省部共建协议的签订为学校搭建了一个支撑发展、多做贡献的好平台，提供了一个特色办学、提升内涵的好契机，打下了一个扩大影响、赢得支持的好基础，在学校发展史上具有里程碑式的意义。”[7]
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