目前IV-OCT技术也有一定的不足，主要包括如下几方面：
1）IV-OCT所用的近红外光穿透性不强，光束在组织中有多重反射，当透过血液和组织成像时会发生血液干扰，图像质量明显下降。
2）成像导管处于血液环境中，单位体积血液内的大量红细胞对OCT光源可产生广泛的散射，从而导致血管壁局部图像失真。第一代OCT导管主要采用两种手段克服这种情况：在成像部位注射生理盐水以阻止红细胞的进入，或者应用低压阻断球囊导管（小于0.5atm）在病变近端阻止血液流动，再利用生理盐水代替局部血液来进行成像，方能获得较清晰的图像。因此对左主干病变、开口病变和心功能较差患者不适宜OCT检查，这是临床应用的最大限制。第二代OCT导管已克服该缺点，不再用球囊导管阻塞血流，大大增加了技术的安全性并方便了临床应用。
3）组织穿透深度小（仅1～1.5mm，而IVUS为4～8mm），扫描范围小（7mm，1VUS为10～15mm），对血管内有大量斑块及血栓的病变，IV-OCT对整体图像的显示较为困难。(www.xing528.com)
4）IV-OCT成像导管由光导纤维组成，容易折断损害，操作时需格外小心，今后需对成像导丝作进一步改善。
目前，研究人员正在研发新一代的IV-OCT成像系统，用于成像的光源也在不断改进，新的IV-OCT成像系统有望在穿透性上有所改进，并且无须阻断冠脉血流，如OFDI可进一步增强图像分辨率和清晰度；虚拟组织OCT（OCT-VH）用颜色标定对光束的后向散射与衰减，显示组织特征；内膜面沿长轴展开显示可直观地以平面方式显示血管病变；三维重建技术则可在三维空间显示血管结构。随着技术的不断进步，更加清晰、安全、准确的成像技术将用于诊断冠状动脉病变及评价介入治疗的效果。不久的将来，OCT将不仅仅可以提供长血管壁的详细结构信息，也将可以提供血管内的血流动力学及显微动力学的完整信息。通过与OCT荧光技术及纳米颗粒标记的结合使用，将可以进一步扩大OCT的使用范围。
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