【摘要】：16S rRNA序列测序情况及各分类地位数量如表3-1所示。由表3-1可知，根据100%序列相似性聚类分析后，共得到122 081条代表性序列，根据97%序列相似性聚类分析后，共得到8 030个OTU，经嵌合体检查后剩余7 639个OTU，平均每个样品1 628个。因而本研究平均每个样品产生36 020条序列的测序深度，是符合后续生物信息学分析要求的。
本研究9个丢糟窖窖泥样品共有324 181条高质量16S rRNA V4□V5区序列通过序列拼接过程中的质控，使用PyNAST对序列校准排齐后去除了2条序列，平均每个样品产生36 020条。16S rRNA序列测序情况及各分类地位数量如表3-1所示。
表3-1 样品16S rRNA测序情况及各分类地位数量
注：计算每个样品Chao1和Shannon指数时，样品的测序量均为30 910条序列。(www.xing528.com)
由表3-1可知，根据100%序列相似性聚类分析后，共得到122 081条代表性序列，根据97%序列相似性聚类分析后，共得到8 030个OTU，经嵌合体检查后剩余7 639个OTU，平均每个样品1 628个。经序列比对后，所有序列划分为20个门，47个纲、71个目、153个科和355个属。经配对t检验发现，丢糟窖窖池上部细菌微生物的多样性要显著低于底部（t=－9.811 0，P=0.010 2），而与中部差异不显著（t=2.626 0，P=0.119 5）。通过绘制稀疏曲线图和香农指数曲线图，本研究对测序深度是否符合后续生物信息学分析要求进行了评价，其结果如图3-1所示。
由图3-1（a）可知，尽管每个样品的稀疏曲线尚未达到饱和，但由图3-1（b）可知，香农指数曲线已经进入平台期。这表明，尽管随着测序量的增加窖泥中新的细菌种系型可能会被发现，但其细菌微生物的多样性已经不再随之发生变化了。因而本研究平均每个样品产生36 020条序列的测序深度，是符合后续生物信息学分析要求的。
图3-1 稀疏曲线图（a）和香农指数曲线图（b）
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