泸州老窖是国内浓香型白酒的典型代表，保存有入选吉尼斯世界纪录、拥有400多年窖龄、国内最古老的白酒窖池。对窖泥微生物多样性报道最多的当属对泸州老窖酒业的窖泥研究，研究方法集中在了PLFA、克隆文库、PCR-DGGE（Polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis）及第二代测序技术。
磷脂脂肪酸是生物细胞膜的主要成分，仅存在于活细胞膜中，当微生物死亡后，脂肪酸就会被代谢掉。细胞中包含脂肪酸的脂类物质主要有碳水化合物、脂性醇、磷脂、糖脂和中性脂等[19]。通常这些脂类物质在同一种微生物中是稳定的，并且操作难度与试验条件要求较低，因此PLFA指纹图谱技术被开发出来，在对窖泥、土壤、食品等多种环境的微生物的研究中得到应用[19-21]。Tunlid在1985年首次利用磷脂脂肪酸技术对油菜根际微生物的群落结构进行了研究，此后该技术逐渐被引入其他的微生物研究领域。窖泥是一种特殊的土壤，因此在窖泥微生物的研究中也引入了磷脂脂肪酸技术。刘琨毅[21]等对窖泥微生物的分析表明，厌氧革兰氏阳性菌和真菌是窖泥中的优势菌群，不同窖龄窖泥中的微生物PLFA含量不同，300年窖龄中PLFA含量大于5年与100年窖龄[22]。但是另一研究报道了泸州老窖20、50、100、200、300年窖泥中革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌与需氧菌的比例并无显著差异[23]。(www.xing528.com)
总体上来说，PLFA技术不依赖于分离和培养的技术，更为快速、简便，操作难度更低，但是磷脂脂肪酸分析方法不能对微生物在种或菌株水平上加以区分[25]，所以常与其他分析技术，如DGGE或传统培养方法相结合，用于的窖泥微生物研究。
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