项目审计案卷卷内一般采用“单元排列法”，以结论性文件材料、证明性文件材料、立项性文件材料三个单元为序进行排列。
1.第一单元
第一单元是结论类文件材料，采用逆审计程序并结合文件材料的重要程度进行排列。
①审计结果报告（如有批示列前）
②审计决定书
③审计移送处理书
④审计意见书
⑤审计结果执行反馈单
⑥审计回访单（有关审计结果执行情况的证明材料附后）
⑦审计报告审定稿（审计报告审定单列前）
⑧审计报告征求意见稿（审计报告征求意见单列前）
2.第二单元
第二单元是证明类文件材料，按与审计报告所列问题和审计评价意见相对应的顺序并结合重要程度进行排列。
按照三个层次设计审计实施工作底稿，可根据不同的审计事项选用相应的底稿用纸，具体情况如下：
①汇总审计实施工作底稿(www.xing528.com)
②分项目审计实施工作底稿（相关具体底稿和证明材料列后）
③具体审计实施工作底稿（相关证明材料，如表格、座谈记录等列后）
④审计承诺书
按照单一样式设计审计工作底稿，不同的审计事项选用相同的底稿用纸，但应分别排列，同样能反映审计事项的各个方面。在编制审计工作底稿时，也可以采用各种审计标识、符号，每种标识、符号都代表一种特定的含义，用以区别不同审计事项，可以提高工作效率。
3.第三单元
第三单元是立项类文件材料，按文件形成的时间顺序，并结合文件材料的重要程度进行排列。
①审计立项审批单（如有委托书或举报材料列前）
②审前调查表
③项目审计计划
④审计方案
⑤审计通知书（或口头通知的记录）
⑥审计文书送达回证
排列卷内文件材料时，对内容相关的一组文件要按照批复、批示在前，请示、报告在后；正件在前，附件在后；定稿在前，修改稿在后；重要文件在前，次要文件在后；汇总性文件在前，基础性文件在后的基本规则进行排列。
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