广东推进供给侧结构性改革虽然取得极大成效，但结构性问题仍然突出，主要有如下几个方面：
（1）“三去一降一补”全面完成难度较大。
①去产能中的“僵尸企业”处置难度较大。尚待处置的“僵尸企业”中国有企业遗留问题多，人员包袱重。不少民营企业资料缺失，负债底线不清，推进工作难度大。
②房地产去库存结构性矛盾突出。一方面，三四线城市人口流入少，流出多，人口城镇化进程慢及收入水平不高，商品房库存矛盾较大，去库存手段不多，进程缓慢；另一方面，广州、深圳房价上涨，其投机需求仍然不小，房地产价格调控难度极大。而且它们也没有彻底解决非商品住房过剩情况。
③金融去杠杆仍然存在较大风险。2016年广东查处的非法集资案件占全国10%，非法集资融资问题在“互联网+”的发展大势中表现手法隐秘，查处难度极大；个别农合金融机构流动风险仍然突出。
④降成本任重道远。一是降成本措施使粤东西北地区财政收入压力增大；二是中小微企业融资难及融资贵问题没有得到有效缓解。中国财政科学研究院发布的《降成本：2017年的调查与分析》报告指出，一些银行采取大额授信权限上收总行的集中管理模式，推行“一刀切”的限贷政策，抽贷、断贷现象严重，使中小微企业融资难问题没有得到有效缓解[15]；同时，“短贷长用”现象非常普遍，带来了不小的金融风险。当前中小企业融资成本高，根本原因在于金融与企业之间的“经络”不通，二者没有实现良性循环。一方面，部分资金未投向实体经济，使融资环境恶化；另一方面，资金在金融体系内循环，导致风险剧增。
⑤补短板制约因素较多。一是粤东西北发展远远滞后于珠三角地区，但面临许多发展瓶颈制约。长期以来，珠江三角洲以占广东全省30.50%的土地面积、53.80%的常住人口，贡献了约79%以上的GDP总量。比如，尽管人均GDP一度有差距缩小的趋势，但珠三角与粤北山区的差距依然保持在3.6∶1以上的水平。二是公共服务供给不足。教育、医疗、文化、体育等公共服务规模不足、水平不高，城乡区域间资源配置不均衡，服务水平差异大；社会保障全省统筹不足，社会救助和社会福利体系不完善。三是补短板个别重点任务完成进度迟缓，补短板项目中的部分计划新开工基础设施项目存在报批报建、要素保障及征迁问题。
（2）“放管服”行政体制改革有待继续深化。
在强力推进行政改革过程中，各级政府改革政策供给太快、太多，体系乱、概念多，有的还存在一些冲突，造成一些地方和部门思想认识乱，群众和企业对制度改革也缺乏基本预期。
①改革进程中附加功能“过多”。
大的方面说，刚开始只是行政审批制度改革，紧接着是行政管理体制改革，再就是全面深化改革和构建新型国家治理体系，从“放”“管”两个轮子都要圆到“放管服”三管齐下再到“放管服转效”五位一体；小的方面讲，以清单制度为例，刚开始还纠结于是审批权力清单还是所有行政权力清单，接着又引入了责任清单概念，再就是开始探索负面清单，有的地方提出了监管清单、服务清单、资格认定清单和财政支出清单等。从中不难看出政府改革力求改变过去重权力轻责任，重发展轻民生，重企业轻民众，重生产轻生活等价值导向和功能追求，但仍然附加了过多功能。
②改革政策供给“过快”。(www.xing528.com)
不少改革推进机构完成任务般地出台了大量政策文件。部门和地方应接不暇，前面改革政策没落实，后面改革政策又来了，来不及研究消化，改一改文字就进行了转发。不少市县也没深入研究，没拿出务实落地举措，一些地方取消了不知道，下放了接不住，接下了没优化，继续卡、繁、难。经常可以看到地方政府部门改与法难抉、利与义难全、放管间犹豫、线上下徘徊的情绪和心理。
③改革名目“过杂”。
有的地方三证合一，一证三号在试点，有的地方已经开始三证合一、一证一码改革，有的甚至在进行五证合一的探索。
（3）创新驱动发展环境仍然存在诸多问题。
①知识产权不到位。存在违法成本较低，维权成本较高等问题，知识产权“认定难”“执行难”的困局仍然未破解。
②创新环境不够完善。企业家创新精神尚未真正得到充分激发和保护，鼓励创新、允许失败、宽容失败的文化氛围还未真正形成。
（4）传统产业转型升级仍然艰难。
①钢铁、水泥、造纸、化工等资源型耗能污染大的传统产业普遍产能过剩，制约产业链中下游产品质量提升。
②珠三角一些低端产业项目升级困难而转移动力又不足，无法为当地新兴产业落地与发展腾出空间。
③粤东西北有些承接产业转移的项目技术含量低，附加值不高。
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