习近平总书记指出，科技领域是最需要不断改革的领域，要敢于啃硬骨头，敢于涉险滩、闯难关，破除一切制约科技创新的思想障碍和制度藩篱；要坚持科技创新和制度创新“双轮驱动”，以问题为导向，以需求为牵引，在实践载体、制度安排、政策保障、环境营造上下功夫，在创新主体、创新基础、创新资源、创新环境等方面持续用力。[39]习近平总书记的重要论述，把科技创新和制度创新统筹了起来，从生产力和生产关系辩证统一的高度，对深化创新体制机制改革作出系统部署和安排。
（一）坚持抓主要矛盾，明确要紧紧围绕科技和经济社会发展深度融合推进改革
习近平总书记指出，深化科技改革这篇文章怎么做？改革的目标只有一个，那就是要进一步打通科技和经济社会发展之间的通道。[40]这就告诉我们，目前的主要矛盾是科技与经济结合不够紧密。推进科技与经济社会发展深度融合，是推动科技体制改革的出发点和落脚点。
从实验室技术到商业化应用，一般要经过小试、中试等步骤才能实现量产，需要解决一系列复杂的工程技术问题，具有较高的失败风险，学者们将这一阶段称为“死亡之谷”。科研成果跨越“死亡之谷”是一个全球性的难题，在我国表现得尤为突出。因此，要牢牢抓住这一主要矛盾，取消一系列影响创新链条顺畅运转的体制机制“关卡”，坚持把企业作为推动科技成果转化的主体，广泛调动科技人员、高校、科研院所等积极性，动员多方面力量，着力打通科技与经济结合通道的“最后一公里”。
党的十八大以来，以习近平同志为核心的党中央紧紧围绕促进科技与经济深度融合推进科技体制改革，取得了明显成效。在保护知识产权方面，坚决革新知识产权保护的体制机制，破解侵权易、维权难的突出难题。在激励科技人员方面，启动职务科技成果权属混合所有制改革，允许管理人员和科研人员持有股份，激发创新主体转化成果的内生动力。在金融支持方面，推动上海证券交易所设立科创板并试点注册制，积极推动投贷联动金融服务模式创新，积极破解科技成果转化的融资难问题。
（二）坚持系统思维方法，切实把推进科技体制改革和经济体制改革统筹协同起来
创新是一个系统工程，创新链、产业链、资金链、政策链相互交织、相互支撑，改革只在一个环节或几个环节搞是不够的，必须全面部署，坚定不移推进。破解制约创新的体制机制难题，要运用系统思维方法，考虑创新的经济因素，同时考虑制度、组织、社会、政治等因素，做好改革的顶层设计，保持战略定力，发扬钉钉子精神，才能从根本上塑造有利于创新的制度环境。(www.xing528.com)
改革开放40余年来，我国建立起了一套有利于要素驱动、投资驱动的制度政策环境，要推动经济社会发展向创新驱动转变，需要对整个制度体系进行一次系统性的改革调整，涉及方方面面的改革。习近平总书记指出，科技体制改革必须与其他方面改革协同推进，加强和完善科技创新管理，促进创新链、产业链、市场需求有机衔接。我们深刻认识到，实施创新驱动发展战略是一项系统工程，必须用系统思维方法，突出改革的系统性、整体性、协同性，全面推进科技体制改革、经济体制改革以及其他方面的改革，才能够取得实效。
党的十八大以来，以习近平同志为核心的党中央全面分析影响创新驱动发展的体制机制因素，在构建国家创新体系特别是放宽市场准入、破除垄断和市场分割、建设协同创新平台、加大创新型小微企业支持力度、完善风险投资机制、加大财税金融支持、促进人才培养和流动、推动科研院所改革等方面，研究推出了一系列管长远的改革方案，加强科技体制改革与经济、教育、金融等体制改革的衔接，从市场环境、科技管理、创新人才等方面，破除了一系列制约创新的体制机制改革障碍。
（三）坚持试点试验先行，强调要通过全面创新改革试验探索可复制推广的好经验好做法
试点是重要改革任务，更是重要改革方法。随着改革不断深入，其艰巨性、复杂性、系统性愈加凸显，啃下改革硬骨头，就需要发挥好试点对改革全局的示范、突破和带动作用，通过试点探索改革的实现路径和形式，为面上改革提供可复制推广的经验做法。近年来，党中央聚焦重大改革任务，深耕细作改革“试验田”，为推进全国面上改革积累了丰富经验。实践证明，试点能否迈开步子、趟出路子，直接关系改革成效。
习近平总书记指出，要遵循区域创新高度集聚的规律，研究在一些省区市系统推进全面创新改革试验，授权这些地区在知识产权、科研院所、高等教育、人才流动、国际合作等多方面改革，形成几个具有创新示范和带动作用的区域性创新平台。[41] 2015年9月7日，《关于在部分区域系统推进全面创新改革试验的总体方案》正式公布，京津冀、上海、广东、安徽、四川、武汉、西安、沈阳等被确定为全面创新改革试验区域。
经过四年多的改革试验，全面创新改革试验取得了重要成效，突破了一批制约创新发展的体制机制障碍，形成了若干可复制推广的改革成果。全面创新改革试验区域研发投入持续增长，创新活力不断迸发，科技与经济改革发展更加协同，率先向创新驱动转型迈出实质性步伐。
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