上文提到的远东委员会采纳的中间赔偿计划在相关各国中分别进行，1947年4月，根据代表远东委员会的美国政府的决定，先将预定拆除的三成工业生产能力立时移交，并向同盟国最高司令官下达相关指令。根据指令，该部分工业生产能力分配如下：一成五给中国，半成给菲律宾，半成给荷兰（荷属东印度），半成给英国（缅甸、马来以及其他远东殖民地）。
以上预付计划的第一部分先从兵工厂等开始着手，1948年1月，以第一艘运输船驶向中国为开端，开始进行中间拆除和运输。然而，如前文所述，美国的方针因美苏对立而有所改变，1949年5月，美国发表声明停止中间赔偿拆除，美国关于按国家分配的提案也就此取消。因此，除已经分配的部分，其余设施停止拆除，1950年5月开往菲律宾的最后一艘运输船为移交画上了句号。这期间移交给各国的设施价值以1939年的汇率计算，约为1.64亿日元。
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1957年5月号的《文艺春秋》中有一篇伊藤正德的名为《大海军的遗产》的文章。下面是该文章中的一段话，大概能够从侧面反映出当时的拆除赔偿吧。
“停战之后，中华民国政府要求将神户的川崎造船厂作为其战利品。由于造船厂是私有财产，因此事情陷入僵局，最后从吴海兵工厂将一对子母齿轮切削机作为赔偿运往中国。这是曾在大和战舰的建造过程中使用过的切削机，是一台直径为五米半的庞然大物，其中的小切削机直径也有三米，可以称得上是天下极品。英美赔偿委员们颇为不解：‘这些我们都很少使用到的设备，中国拿去打算做什么呢？’但是中国委员却因为听说日本海军的齿轮切削机是日本的国宝，就格外想要得到，想方设法地弄到自己手里。然而共产党治下的中国受工业技术水平所限，直至今日也未能熟练使用该设备。从1957年3月到现在，大切削机被草席裹着在上海仓库里已经闲置十年之久。而当我们试图去寻找小切削机的下落时，却得知它们母子相别，以同样的状态被孤零零地深锁在天津仓库里。应该说这是一对天下难寻的切削机。”
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